Protein–RNA interactions for Protein: Q16778

HIST2H2BE, Histone H2B type 2-E, humanhuman

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST2H2BEQ16778 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HIST2H2BEQ16778 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HIST2H2BEQ16778 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HIST2H2BEQ16778 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HIST2H2BEQ16778 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HIST2H2BEQ16778 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HIST2H2BEQ16778 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HIST2H2BEQ16778 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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HIST2H2BEQ16778 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HIST2H2BEQ16778 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HIST2H2BEQ16778 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HIST2H2BEQ16778 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HIST2H2BEQ16778 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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HIST2H2BEQ16778 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
HIST2H2BEQ16778 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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HIST2H2BEQ16778 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HIST2H2BEQ16778 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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HIST2H2BEQ16778 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HIST2H2BEQ16778 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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HIST2H2BEQ16778 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HIST2H2BEQ16778 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HIST2H2BEQ16778 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HIST2H2BEQ16778 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HIST2H2BEQ16778 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HIST2H2BEQ16778 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HIST2H2BEQ16778 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HIST2H2BEQ16778 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HIST2H2BEQ16778 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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HIST2H2BEQ16778 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HIST2H2BEQ16778 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HIST2H2BEQ16778 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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HIST2H2BEQ16778 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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