Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ZNF239Q16600 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ZNF239Q16600 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
ZNF239Q16600 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ZNF239Q16600 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ZNF239Q16600 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ZNF239Q16600 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ZNF239Q16600 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ZNF239Q16600 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ZNF239Q16600 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ZNF239Q16600 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ZNF239Q16600 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ZNF239Q16600 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ZNF239Q16600 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ZNF239Q16600 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ZNF239Q16600 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ZNF239Q16600 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ZNF239Q16600 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ZNF239Q16600 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ZNF239Q16600 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ZNF239Q16600 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ZNF239Q16600 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ZNF239Q16600 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ZNF239Q16600 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ZNF239Q16600 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ZNF239Q16600 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ZNF239Q16600 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ZNF239Q16600 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
ZNF239Q16600 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ZNF239Q16600 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ZNF239Q16600 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ZNF239Q16600 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ZNF239Q16600 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ZNF239Q16600 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ZNF239Q16600 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ZNF239Q16600 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ZNF239Q16600 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ZNF239Q16600 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ZNF239Q16600 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ZNF239Q16600 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ZNF239Q16600 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ZNF239Q16600 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ZNF239Q16600 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ZNF239Q16600 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ZNF239Q16600 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ZNF239Q16600 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ZNF239Q16600 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ZNF239Q16600 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ZNF239Q16600 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ZNF239Q16600 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ZNF239Q16600 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ZNF239Q16600 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ZNF239Q16600 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ZNF239Q16600 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
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ZNF239Q16600 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ZNF239Q16600 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
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ZNF239Q16600 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ZNF239Q16600 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ZNF239Q16600 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ZNF239Q16600 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ZNF239Q16600 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ZNF239Q16600 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ZNF239Q16600 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ZNF239Q16600 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
ZNF239Q16600 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
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ZNF239Q16600 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
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ZNF239Q16600 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ZNF239Q16600 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ZNF239Q16600 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ZNF239Q16600 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZNF239Q16600 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZNF239Q16600 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZNF239Q16600 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZNF239Q16600 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZNF239Q16600 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZNF239Q16600 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZNF239Q16600 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
ZNF239Q16600 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
ZNF239Q16600 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZNF239Q16600 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZNF239Q16600 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZNF239Q16600 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZNF239Q16600 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZNF239Q16600 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZNF239Q16600 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZNF239Q16600 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ZNF239Q16600 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ZNF239Q16600 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ZNF239Q16600 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ZNF239Q16600 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ZNF239Q16600 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ZNF239Q16600 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ZNF239Q16600 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ZNF239Q16600 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ZNF239Q16600 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
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