Protein–RNA interactions for Protein: Q16527

CSRP2, Cysteine and glycine-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP2Q16527 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSRP2Q16527 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSRP2Q16527 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSRP2Q16527 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSRP2Q16527 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSRP2Q16527 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSRP2Q16527 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CSRP2Q16527 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CSRP2Q16527 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSRP2Q16527 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CSRP2Q16527 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSRP2Q16527 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSRP2Q16527 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSRP2Q16527 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSRP2Q16527 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSRP2Q16527 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSRP2Q16527 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSRP2Q16527 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSRP2Q16527 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSRP2Q16527 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSRP2Q16527 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSRP2Q16527 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSRP2Q16527 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CSRP2Q16527 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSRP2Q16527 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSRP2Q16527 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSRP2Q16527 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSRP2Q16527 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CSRP2Q16527 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSRP2Q16527 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSRP2Q16527 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CSRP2Q16527 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CSRP2Q16527 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CSRP2Q16527 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CSRP2Q16527 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CSRP2Q16527 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CSRP2Q16527 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CSRP2Q16527 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CSRP2Q16527 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CSRP2Q16527 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CSRP2Q16527 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CSRP2Q16527 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CSRP2Q16527 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CSRP2Q16527 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CSRP2Q16527 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CSRP2Q16527 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CSRP2Q16527 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSRP2Q16527 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSRP2Q16527 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSRP2Q16527 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSRP2Q16527 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSRP2Q16527 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSRP2Q16527 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSRP2Q16527 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSRP2Q16527 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSRP2Q16527 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CSRP2Q16527 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSRP2Q16527 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CSRP2Q16527 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CSRP2Q16527 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CSRP2Q16527 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CSRP2Q16527 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CSRP2Q16527 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CSRP2Q16527 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CSRP2Q16527 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CSRP2Q16527 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CSRP2Q16527 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CSRP2Q16527 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CSRP2Q16527 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
CSRP2Q16527 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CSRP2Q16527 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CSRP2Q16527 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CSRP2Q16527 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CSRP2Q16527 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CSRP2Q16527 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CSRP2Q16527 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CSRP2Q16527 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CSRP2Q16527 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CSRP2Q16527 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CSRP2Q16527 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CSRP2Q16527 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CSRP2Q16527 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CSRP2Q16527 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CSRP2Q16527 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CSRP2Q16527 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CSRP2Q16527 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CSRP2Q16527 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CSRP2Q16527 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CSRP2Q16527 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CSRP2Q16527 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CSRP2Q16527 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CSRP2Q16527 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CSRP2Q16527 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CSRP2Q16527 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CSRP2Q16527 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CSRP2Q16527 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CSRP2Q16527 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CSRP2Q16527 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CSRP2Q16527 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CSRP2Q16527 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
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