Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
VPS72Q15906 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
VPS72Q15906 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
VPS72Q15906 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
VPS72Q15906 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
VPS72Q15906 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
VPS72Q15906 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
VPS72Q15906 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
VPS72Q15906 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
VPS72Q15906 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
VPS72Q15906 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
VPS72Q15906 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
VPS72Q15906 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
VPS72Q15906 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
VPS72Q15906 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
VPS72Q15906 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
VPS72Q15906 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
VPS72Q15906 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
VPS72Q15906 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
VPS72Q15906 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
VPS72Q15906 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
VPS72Q15906 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
VPS72Q15906 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
VPS72Q15906 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
VPS72Q15906 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
VPS72Q15906 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
VPS72Q15906 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
VPS72Q15906 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
VPS72Q15906 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
VPS72Q15906 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
VPS72Q15906 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
VPS72Q15906 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
VPS72Q15906 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
VPS72Q15906 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
VPS72Q15906 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
VPS72Q15906 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
VPS72Q15906 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
VPS72Q15906 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
VPS72Q15906 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
VPS72Q15906 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
VPS72Q15906 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
VPS72Q15906 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
VPS72Q15906 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
VPS72Q15906 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
VPS72Q15906 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
VPS72Q15906 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
VPS72Q15906 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
VPS72Q15906 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
VPS72Q15906 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
VPS72Q15906 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
VPS72Q15906 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
VPS72Q15906 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
VPS72Q15906 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
VPS72Q15906 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
VPS72Q15906 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
VPS72Q15906 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
VPS72Q15906 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
VPS72Q15906 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
VPS72Q15906 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
VPS72Q15906 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
VPS72Q15906 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
VPS72Q15906 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
VPS72Q15906 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC28.69■■■□□ 2.18
VPS72Q15906 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
VPS72Q15906 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
VPS72Q15906 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
VPS72Q15906 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
VPS72Q15906 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
VPS72Q15906 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
VPS72Q15906 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
VPS72Q15906 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
VPS72Q15906 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
VPS72Q15906 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
VPS72Q15906 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
VPS72Q15906 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
VPS72Q15906 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
VPS72Q15906 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
VPS72Q15906 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
VPS72Q15906 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
VPS72Q15906 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
VPS72Q15906 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
VPS72Q15906 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
VPS72Q15906 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
VPS72Q15906 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
VPS72Q15906 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC28.67■■■□□ 2.18
VPS72Q15906 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
VPS72Q15906 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
VPS72Q15906 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
VPS72Q15906 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
VPS72Q15906 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
VPS72Q15906 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
VPS72Q15906 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
VPS72Q15906 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
VPS72Q15906 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
VPS72Q15906 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
VPS72Q15906 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
VPS72Q15906 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
VPS72Q15906 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
VPS72Q15906 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
VPS72Q15906 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
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