Protein–RNA interactions for Protein: Q15513

SPHAR, Protein SPHAR, humanhuman

Predictions only

Length 63 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHARQ15513 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SPHARQ15513 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SPHARQ15513 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SPHARQ15513 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SPHARQ15513 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SPHARQ15513 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SPHARQ15513 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SPHARQ15513 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SPHARQ15513 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SPHARQ15513 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SPHARQ15513 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SPHARQ15513 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPHARQ15513 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPHARQ15513 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPHARQ15513 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPHARQ15513 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPHARQ15513 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPHARQ15513 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPHARQ15513 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPHARQ15513 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SPHARQ15513 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPHARQ15513 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPHARQ15513 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPHARQ15513 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPHARQ15513 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPHARQ15513 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPHARQ15513 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPHARQ15513 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPHARQ15513 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPHARQ15513 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPHARQ15513 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SPHARQ15513 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SPHARQ15513 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SPHARQ15513 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SPHARQ15513 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SPHARQ15513 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SPHARQ15513 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SPHARQ15513 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SPHARQ15513 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SPHARQ15513 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SPHARQ15513 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SPHARQ15513 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SPHARQ15513 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SPHARQ15513 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SPHARQ15513 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SPHARQ15513 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SPHARQ15513 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SPHARQ15513 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SPHARQ15513 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SPHARQ15513 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SPHARQ15513 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SPHARQ15513 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SPHARQ15513 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPHARQ15513 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPHARQ15513 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPHARQ15513 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPHARQ15513 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPHARQ15513 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPHARQ15513 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPHARQ15513 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPHARQ15513 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPHARQ15513 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPHARQ15513 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPHARQ15513 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPHARQ15513 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPHARQ15513 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPHARQ15513 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPHARQ15513 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPHARQ15513 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPHARQ15513 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPHARQ15513 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPHARQ15513 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPHARQ15513 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPHARQ15513 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPHARQ15513 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPHARQ15513 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPHARQ15513 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPHARQ15513 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPHARQ15513 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPHARQ15513 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPHARQ15513 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPHARQ15513 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPHARQ15513 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPHARQ15513 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPHARQ15513 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPHARQ15513 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SPHARQ15513 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPHARQ15513 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPHARQ15513 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPHARQ15513 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPHARQ15513 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPHARQ15513 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPHARQ15513 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPHARQ15513 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPHARQ15513 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPHARQ15513 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPHARQ15513 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPHARQ15513 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPHARQ15513 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPHARQ15513 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms