Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIX1Q15475 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIX1Q15475 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIX1Q15475 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIX1Q15475 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIX1Q15475 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIX1Q15475 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIX1Q15475 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIX1Q15475 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIX1Q15475 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIX1Q15475 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SIX1Q15475 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SIX1Q15475 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SIX1Q15475 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SIX1Q15475 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SIX1Q15475 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SIX1Q15475 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SIX1Q15475 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SIX1Q15475 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SIX1Q15475 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SIX1Q15475 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SIX1Q15475 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SIX1Q15475 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SIX1Q15475 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SIX1Q15475 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SIX1Q15475 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SIX1Q15475 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SIX1Q15475 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SIX1Q15475 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SIX1Q15475 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SIX1Q15475 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIX1Q15475 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIX1Q15475 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIX1Q15475 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIX1Q15475 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIX1Q15475 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIX1Q15475 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIX1Q15475 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIX1Q15475 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIX1Q15475 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIX1Q15475 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIX1Q15475 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIX1Q15475 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIX1Q15475 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIX1Q15475 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIX1Q15475 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIX1Q15475 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SIX1Q15475 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SIX1Q15475 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SIX1Q15475 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SIX1Q15475 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SIX1Q15475 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SIX1Q15475 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SIX1Q15475 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SIX1Q15475 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SIX1Q15475 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SIX1Q15475 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SIX1Q15475 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SIX1Q15475 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SIX1Q15475 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SIX1Q15475 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SIX1Q15475 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIX1Q15475 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIX1Q15475 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIX1Q15475 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SIX1Q15475 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIX1Q15475 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIX1Q15475 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIX1Q15475 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIX1Q15475 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIX1Q15475 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIX1Q15475 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIX1Q15475 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIX1Q15475 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIX1Q15475 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIX1Q15475 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIX1Q15475 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIX1Q15475 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIX1Q15475 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIX1Q15475 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIX1Q15475 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIX1Q15475 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIX1Q15475 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIX1Q15475 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIX1Q15475 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIX1Q15475 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIX1Q15475 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIX1Q15475 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIX1Q15475 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIX1Q15475 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIX1Q15475 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIX1Q15475 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIX1Q15475 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIX1Q15475 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIX1Q15475 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIX1Q15475 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIX1Q15475 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIX1Q15475 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIX1Q15475 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIX1Q15475 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms