Protein–RNA interactions for Protein: Q15120

PDK3, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 3, mitochondrial, humanhuman

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK3Q15120 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDK3Q15120 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDK3Q15120 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDK3Q15120 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDK3Q15120 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDK3Q15120 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDK3Q15120 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDK3Q15120 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDK3Q15120 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDK3Q15120 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDK3Q15120 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDK3Q15120 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDK3Q15120 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDK3Q15120 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDK3Q15120 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDK3Q15120 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDK3Q15120 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDK3Q15120 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDK3Q15120 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDK3Q15120 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDK3Q15120 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDK3Q15120 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDK3Q15120 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDK3Q15120 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDK3Q15120 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDK3Q15120 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDK3Q15120 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDK3Q15120 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDK3Q15120 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDK3Q15120 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDK3Q15120 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDK3Q15120 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDK3Q15120 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDK3Q15120 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDK3Q15120 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDK3Q15120 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDK3Q15120 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDK3Q15120 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDK3Q15120 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDK3Q15120 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDK3Q15120 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDK3Q15120 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDK3Q15120 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDK3Q15120 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDK3Q15120 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PDK3Q15120 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDK3Q15120 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDK3Q15120 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDK3Q15120 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDK3Q15120 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDK3Q15120 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDK3Q15120 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDK3Q15120 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDK3Q15120 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDK3Q15120 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDK3Q15120 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDK3Q15120 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDK3Q15120 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDK3Q15120 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDK3Q15120 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDK3Q15120 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDK3Q15120 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDK3Q15120 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PDK3Q15120 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDK3Q15120 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDK3Q15120 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDK3Q15120 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDK3Q15120 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDK3Q15120 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDK3Q15120 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDK3Q15120 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDK3Q15120 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PDK3Q15120 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDK3Q15120 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PDK3Q15120 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDK3Q15120 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDK3Q15120 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDK3Q15120 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDK3Q15120 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDK3Q15120 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDK3Q15120 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDK3Q15120 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDK3Q15120 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDK3Q15120 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDK3Q15120 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDK3Q15120 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDK3Q15120 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDK3Q15120 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDK3Q15120 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDK3Q15120 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDK3Q15120 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDK3Q15120 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDK3Q15120 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PDK3Q15120 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PDK3Q15120 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDK3Q15120 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDK3Q15120 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDK3Q15120 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDK3Q15120 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDK3Q15120 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
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