Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NCF4Q15080 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NCF4Q15080 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NCF4Q15080 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NCF4Q15080 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
NCF4Q15080 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NCF4Q15080 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NCF4Q15080 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NCF4Q15080 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NCF4Q15080 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NCF4Q15080 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NCF4Q15080 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
NCF4Q15080 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NCF4Q15080 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NCF4Q15080 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NCF4Q15080 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NCF4Q15080 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NCF4Q15080 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
NCF4Q15080 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NCF4Q15080 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NCF4Q15080 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NCF4Q15080 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NCF4Q15080 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NCF4Q15080 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NCF4Q15080 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NCF4Q15080 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NCF4Q15080 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NCF4Q15080 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NCF4Q15080 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NCF4Q15080 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NCF4Q15080 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NCF4Q15080 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NCF4Q15080 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
NCF4Q15080 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NCF4Q15080 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NCF4Q15080 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NCF4Q15080 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NCF4Q15080 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
NCF4Q15080 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
NCF4Q15080 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
NCF4Q15080 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NCF4Q15080 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NCF4Q15080 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NCF4Q15080 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NCF4Q15080 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NCF4Q15080 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NCF4Q15080 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NCF4Q15080 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NCF4Q15080 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NCF4Q15080 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NCF4Q15080 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NCF4Q15080 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NCF4Q15080 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NCF4Q15080 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NCF4Q15080 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NCF4Q15080 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NCF4Q15080 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NCF4Q15080 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NCF4Q15080 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NCF4Q15080 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NCF4Q15080 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NCF4Q15080 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NCF4Q15080 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NCF4Q15080 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NCF4Q15080 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NCF4Q15080 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NCF4Q15080 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NCF4Q15080 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NCF4Q15080 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NCF4Q15080 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
NCF4Q15080 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NCF4Q15080 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NCF4Q15080 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NCF4Q15080 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NCF4Q15080 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NCF4Q15080 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NCF4Q15080 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NCF4Q15080 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NCF4Q15080 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NCF4Q15080 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
NCF4Q15080 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NCF4Q15080 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NCF4Q15080 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NCF4Q15080 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
NCF4Q15080 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
NCF4Q15080 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NCF4Q15080 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NCF4Q15080 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NCF4Q15080 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NCF4Q15080 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NCF4Q15080 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NCF4Q15080 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NCF4Q15080 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NCF4Q15080 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NCF4Q15080 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NCF4Q15080 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NCF4Q15080 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NCF4Q15080 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NCF4Q15080 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NCF4Q15080 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
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