Protein–RNA interactions for Protein: Q15054

POLD3, DNA polymerase delta subunit 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD3Q15054 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLD3Q15054 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLD3Q15054 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLD3Q15054 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLD3Q15054 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
POLD3Q15054 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLD3Q15054 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLD3Q15054 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
POLD3Q15054 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLD3Q15054 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLD3Q15054 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLD3Q15054 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLD3Q15054 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLD3Q15054 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLD3Q15054 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLD3Q15054 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLD3Q15054 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLD3Q15054 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
POLD3Q15054 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLD3Q15054 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLD3Q15054 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLD3Q15054 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLD3Q15054 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLD3Q15054 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLD3Q15054 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLD3Q15054 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLD3Q15054 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLD3Q15054 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLD3Q15054 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLD3Q15054 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
POLD3Q15054 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
POLD3Q15054 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
POLD3Q15054 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
POLD3Q15054 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
POLD3Q15054 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
POLD3Q15054 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
POLD3Q15054 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLD3Q15054 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLD3Q15054 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLD3Q15054 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLD3Q15054 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLD3Q15054 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLD3Q15054 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLD3Q15054 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLD3Q15054 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLD3Q15054 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLD3Q15054 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLD3Q15054 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLD3Q15054 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLD3Q15054 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLD3Q15054 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
POLD3Q15054 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLD3Q15054 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLD3Q15054 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLD3Q15054 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLD3Q15054 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLD3Q15054 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLD3Q15054 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLD3Q15054 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
POLD3Q15054 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLD3Q15054 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLD3Q15054 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLD3Q15054 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLD3Q15054 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLD3Q15054 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLD3Q15054 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLD3Q15054 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLD3Q15054 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLD3Q15054 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLD3Q15054 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLD3Q15054 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLD3Q15054 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLD3Q15054 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLD3Q15054 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLD3Q15054 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLD3Q15054 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLD3Q15054 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLD3Q15054 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLD3Q15054 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLD3Q15054 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLD3Q15054 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLD3Q15054 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
POLD3Q15054 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLD3Q15054 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLD3Q15054 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLD3Q15054 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
POLD3Q15054 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLD3Q15054 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLD3Q15054 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLD3Q15054 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLD3Q15054 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLD3Q15054 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLD3Q15054 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLD3Q15054 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLD3Q15054 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
POLD3Q15054 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLD3Q15054 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLD3Q15054 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLD3Q15054 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLD3Q15054 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms