Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NCAPHQ15003 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NCAPHQ15003 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NCAPHQ15003 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NCAPHQ15003 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NCAPHQ15003 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NCAPHQ15003 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NCAPHQ15003 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NCAPHQ15003 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NCAPHQ15003 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NCAPHQ15003 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NCAPHQ15003 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NCAPHQ15003 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NCAPHQ15003 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NCAPHQ15003 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
NCAPHQ15003 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NCAPHQ15003 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NCAPHQ15003 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NCAPHQ15003 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NCAPHQ15003 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NCAPHQ15003 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NCAPHQ15003 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NCAPHQ15003 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NCAPHQ15003 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NCAPHQ15003 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NCAPHQ15003 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NCAPHQ15003 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NCAPHQ15003 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NCAPHQ15003 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NCAPHQ15003 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NCAPHQ15003 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NCAPHQ15003 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
NCAPHQ15003 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NCAPHQ15003 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NCAPHQ15003 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NCAPHQ15003 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NCAPHQ15003 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NCAPHQ15003 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NCAPHQ15003 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NCAPHQ15003 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NCAPHQ15003 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NCAPHQ15003 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NCAPHQ15003 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NCAPHQ15003 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NCAPHQ15003 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NCAPHQ15003 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NCAPHQ15003 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NCAPHQ15003 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
NCAPHQ15003 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NCAPHQ15003 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
NCAPHQ15003 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
NCAPHQ15003 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
NCAPHQ15003 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NCAPHQ15003 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NCAPHQ15003 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NCAPHQ15003 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NCAPHQ15003 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NCAPHQ15003 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NCAPHQ15003 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NCAPHQ15003 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NCAPHQ15003 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NCAPHQ15003 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NCAPHQ15003 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NCAPHQ15003 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NCAPHQ15003 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NCAPHQ15003 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
NCAPHQ15003 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
NCAPHQ15003 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
NCAPHQ15003 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NCAPHQ15003 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
NCAPHQ15003 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
NCAPHQ15003 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
NCAPHQ15003 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
NCAPHQ15003 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
NCAPHQ15003 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
NCAPHQ15003 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
NCAPHQ15003 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NCAPHQ15003 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NCAPHQ15003 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NCAPHQ15003 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NCAPHQ15003 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
NCAPHQ15003 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NCAPHQ15003 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NCAPHQ15003 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NCAPHQ15003 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NCAPHQ15003 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NCAPHQ15003 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NCAPHQ15003 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NCAPHQ15003 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NCAPHQ15003 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NCAPHQ15003 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NCAPHQ15003 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NCAPHQ15003 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NCAPHQ15003 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NCAPHQ15003 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NCAPHQ15003 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NCAPHQ15003 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NCAPHQ15003 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NCAPHQ15003 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NCAPHQ15003 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
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