Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GPNMBQ14956 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GPNMBQ14956 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GPNMBQ14956 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GPNMBQ14956 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPNMBQ14956 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPNMBQ14956 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPNMBQ14956 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPNMBQ14956 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPNMBQ14956 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPNMBQ14956 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPNMBQ14956 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPNMBQ14956 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPNMBQ14956 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPNMBQ14956 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPNMBQ14956 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
GPNMBQ14956 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GPNMBQ14956 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GPNMBQ14956 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GPNMBQ14956 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GPNMBQ14956 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GPNMBQ14956 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GPNMBQ14956 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GPNMBQ14956 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GPNMBQ14956 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GPNMBQ14956 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GPNMBQ14956 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GPNMBQ14956 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GPNMBQ14956 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GPNMBQ14956 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GPNMBQ14956 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
GPNMBQ14956 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GPNMBQ14956 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GPNMBQ14956 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GPNMBQ14956 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GPNMBQ14956 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
GPNMBQ14956 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GPNMBQ14956 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GPNMBQ14956 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GPNMBQ14956 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GPNMBQ14956 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GPNMBQ14956 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GPNMBQ14956 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GPNMBQ14956 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GPNMBQ14956 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GPNMBQ14956 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GPNMBQ14956 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GPNMBQ14956 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GPNMBQ14956 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GPNMBQ14956 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GPNMBQ14956 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GPNMBQ14956 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
GPNMBQ14956 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GPNMBQ14956 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GPNMBQ14956 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GPNMBQ14956 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GPNMBQ14956 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GPNMBQ14956 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GPNMBQ14956 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GPNMBQ14956 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
GPNMBQ14956 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
GPNMBQ14956 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GPNMBQ14956 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GPNMBQ14956 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GPNMBQ14956 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GPNMBQ14956 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GPNMBQ14956 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GPNMBQ14956 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GPNMBQ14956 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GPNMBQ14956 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPNMBQ14956 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPNMBQ14956 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPNMBQ14956 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPNMBQ14956 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPNMBQ14956 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
GPNMBQ14956 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
GPNMBQ14956 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPNMBQ14956 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPNMBQ14956 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPNMBQ14956 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPNMBQ14956 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPNMBQ14956 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPNMBQ14956 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
GPNMBQ14956 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPNMBQ14956 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPNMBQ14956 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GPNMBQ14956 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GPNMBQ14956 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GPNMBQ14956 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GPNMBQ14956 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GPNMBQ14956 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GPNMBQ14956 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
GPNMBQ14956 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
GPNMBQ14956 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GPNMBQ14956 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GPNMBQ14956 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GPNMBQ14956 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GPNMBQ14956 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GPNMBQ14956 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GPNMBQ14956 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms