Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

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Length 502 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NFIXQ14938 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NFIXQ14938 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NFIXQ14938 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NFIXQ14938 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NFIXQ14938 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NFIXQ14938 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
NFIXQ14938 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NFIXQ14938 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NFIXQ14938 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
NFIXQ14938 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
NFIXQ14938 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NFIXQ14938 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NFIXQ14938 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NFIXQ14938 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NFIXQ14938 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NFIXQ14938 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NFIXQ14938 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NFIXQ14938 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NFIXQ14938 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
NFIXQ14938 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
NFIXQ14938 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NFIXQ14938 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NFIXQ14938 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NFIXQ14938 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NFIXQ14938 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NFIXQ14938 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NFIXQ14938 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
NFIXQ14938 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
NFIXQ14938 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
NFIXQ14938 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NFIXQ14938 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NFIXQ14938 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NFIXQ14938 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NFIXQ14938 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NFIXQ14938 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NFIXQ14938 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
NFIXQ14938 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NFIXQ14938 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NFIXQ14938 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NFIXQ14938 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NFIXQ14938 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NFIXQ14938 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NFIXQ14938 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NFIXQ14938 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NFIXQ14938 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NFIXQ14938 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NFIXQ14938 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NFIXQ14938 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NFIXQ14938 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NFIXQ14938 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NFIXQ14938 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NFIXQ14938 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NFIXQ14938 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NFIXQ14938 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NFIXQ14938 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NFIXQ14938 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NFIXQ14938 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
NFIXQ14938 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NFIXQ14938 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NFIXQ14938 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.92
NFIXQ14938 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NFIXQ14938 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NFIXQ14938 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NFIXQ14938 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NFIXQ14938 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
NFIXQ14938 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
NFIXQ14938 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NFIXQ14938 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NFIXQ14938 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
NFIXQ14938 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
NFIXQ14938 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NFIXQ14938 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NFIXQ14938 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NFIXQ14938 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NFIXQ14938 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NFIXQ14938 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NFIXQ14938 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NFIXQ14938 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NFIXQ14938 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NFIXQ14938 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NFIXQ14938 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NFIXQ14938 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NFIXQ14938 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NFIXQ14938 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NFIXQ14938 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NFIXQ14938 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NFIXQ14938 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NFIXQ14938 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NFIXQ14938 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NFIXQ14938 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NFIXQ14938 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NFIXQ14938 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NFIXQ14938 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NFIXQ14938 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NFIXQ14938 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NFIXQ14938 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NFIXQ14938 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NFIXQ14938 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NFIXQ14938 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
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