Protein–RNA interactions for Protein: Q14123

PDE1C, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1CQ14123 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE1CQ14123 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE1CQ14123 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE1CQ14123 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE1CQ14123 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE1CQ14123 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE1CQ14123 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE1CQ14123 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE1CQ14123 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDE1CQ14123 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDE1CQ14123 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDE1CQ14123 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDE1CQ14123 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDE1CQ14123 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDE1CQ14123 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDE1CQ14123 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDE1CQ14123 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDE1CQ14123 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PDE1CQ14123 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDE1CQ14123 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDE1CQ14123 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDE1CQ14123 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDE1CQ14123 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDE1CQ14123 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDE1CQ14123 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE1CQ14123 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE1CQ14123 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE1CQ14123 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE1CQ14123 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE1CQ14123 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE1CQ14123 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE1CQ14123 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE1CQ14123 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE1CQ14123 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE1CQ14123 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE1CQ14123 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE1CQ14123 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE1CQ14123 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE1CQ14123 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE1CQ14123 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE1CQ14123 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE1CQ14123 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE1CQ14123 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE1CQ14123 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE1CQ14123 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE1CQ14123 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE1CQ14123 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE1CQ14123 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE1CQ14123 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE1CQ14123 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE1CQ14123 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE1CQ14123 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE1CQ14123 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE1CQ14123 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE1CQ14123 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE1CQ14123 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE1CQ14123 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE1CQ14123 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE1CQ14123 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE1CQ14123 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE1CQ14123 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE1CQ14123 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE1CQ14123 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE1CQ14123 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE1CQ14123 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE1CQ14123 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE1CQ14123 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PDE1CQ14123 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE1CQ14123 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE1CQ14123 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE1CQ14123 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE1CQ14123 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE1CQ14123 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE1CQ14123 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE1CQ14123 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE1CQ14123 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE1CQ14123 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE1CQ14123 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PDE1CQ14123 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDE1CQ14123 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDE1CQ14123 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDE1CQ14123 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDE1CQ14123 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDE1CQ14123 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PDE1CQ14123 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PDE1CQ14123 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDE1CQ14123 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PDE1CQ14123 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE1CQ14123 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE1CQ14123 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE1CQ14123 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE1CQ14123 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE1CQ14123 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE1CQ14123 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE1CQ14123 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE1CQ14123 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE1CQ14123 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE1CQ14123 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE1CQ14123 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE1CQ14123 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
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