Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCARB2Q14108 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCARB2Q14108 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCARB2Q14108 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCARB2Q14108 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCARB2Q14108 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCARB2Q14108 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCARB2Q14108 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCARB2Q14108 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SCARB2Q14108 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCARB2Q14108 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCARB2Q14108 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCARB2Q14108 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SCARB2Q14108 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCARB2Q14108 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCARB2Q14108 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCARB2Q14108 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCARB2Q14108 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCARB2Q14108 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCARB2Q14108 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCARB2Q14108 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCARB2Q14108 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SCARB2Q14108 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCARB2Q14108 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCARB2Q14108 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCARB2Q14108 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCARB2Q14108 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCARB2Q14108 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCARB2Q14108 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCARB2Q14108 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCARB2Q14108 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCARB2Q14108 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCARB2Q14108 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCARB2Q14108 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SCARB2Q14108 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCARB2Q14108 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCARB2Q14108 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCARB2Q14108 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCARB2Q14108 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCARB2Q14108 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCARB2Q14108 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCARB2Q14108 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCARB2Q14108 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCARB2Q14108 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCARB2Q14108 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCARB2Q14108 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCARB2Q14108 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCARB2Q14108 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SCARB2Q14108 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCARB2Q14108 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCARB2Q14108 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCARB2Q14108 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCARB2Q14108 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCARB2Q14108 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCARB2Q14108 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCARB2Q14108 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCARB2Q14108 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCARB2Q14108 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCARB2Q14108 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCARB2Q14108 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCARB2Q14108 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCARB2Q14108 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCARB2Q14108 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCARB2Q14108 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCARB2Q14108 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SCARB2Q14108 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCARB2Q14108 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCARB2Q14108 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCARB2Q14108 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCARB2Q14108 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCARB2Q14108 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCARB2Q14108 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCARB2Q14108 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCARB2Q14108 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCARB2Q14108 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCARB2Q14108 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SCARB2Q14108 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SCARB2Q14108 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SCARB2Q14108 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCARB2Q14108 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SCARB2Q14108 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SCARB2Q14108 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SCARB2Q14108 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SCARB2Q14108 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCARB2Q14108 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCARB2Q14108 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCARB2Q14108 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCARB2Q14108 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCARB2Q14108 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCARB2Q14108 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCARB2Q14108 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SCARB2Q14108 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCARB2Q14108 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SCARB2Q14108 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCARB2Q14108 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCARB2Q14108 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCARB2Q14108 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCARB2Q14108 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCARB2Q14108 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCARB2Q14108 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
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