Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
CDK13Q14004 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
CDK13Q14004 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
CDK13Q14004 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
CDK13Q14004 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CDK13Q14004 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CDK13Q14004 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CDK13Q14004 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
CDK13Q14004 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
CDK13Q14004 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CDK13Q14004 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CDK13Q14004 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
CDK13Q14004 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC33.72■■■□□ 2.99
CDK13Q14004 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CDK13Q14004 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
CDK13Q14004 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
CDK13Q14004 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
CDK13Q14004 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
CDK13Q14004 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
CDK13Q14004 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
CDK13Q14004 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
CDK13Q14004 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
CDK13Q14004 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
CDK13Q14004 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
CDK13Q14004 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
CDK13Q14004 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
CDK13Q14004 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
CDK13Q14004 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
CDK13Q14004 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
CDK13Q14004 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
CDK13Q14004 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
CDK13Q14004 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
CDK13Q14004 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
CDK13Q14004 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
CDK13Q14004 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
CDK13Q14004 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
CDK13Q14004 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
CDK13Q14004 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
CDK13Q14004 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
CDK13Q14004 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
CDK13Q14004 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
CDK13Q14004 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.67■■■□□ 2.98
CDK13Q14004 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
CDK13Q14004 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
CDK13Q14004 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
CDK13Q14004 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
CDK13Q14004 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
CDK13Q14004 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
CDK13Q14004 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
CDK13Q14004 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC33.67■■■□□ 2.98
CDK13Q14004 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
CDK13Q14004 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
CDK13Q14004 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
CDK13Q14004 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC33.66■■■□□ 2.98
CDK13Q14004 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
CDK13Q14004 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
CDK13Q14004 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
CDK13Q14004 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
CDK13Q14004 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
CDK13Q14004 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
CDK13Q14004 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
CDK13Q14004 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC33.65■■■□□ 2.98
CDK13Q14004 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
CDK13Q14004 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
CDK13Q14004 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
CDK13Q14004 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
CDK13Q14004 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
CDK13Q14004 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
CDK13Q14004 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
CDK13Q14004 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
CDK13Q14004 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
CDK13Q14004 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
CDK13Q14004 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
CDK13Q14004 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
CDK13Q14004 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
CDK13Q14004 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
CDK13Q14004 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
CDK13Q14004 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
CDK13Q14004 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
CDK13Q14004 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
CDK13Q14004 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.97
CDK13Q14004 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
CDK13Q14004 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
CDK13Q14004 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
CDK13Q14004 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
CDK13Q14004 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
CDK13Q14004 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
CDK13Q14004 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
CDK13Q14004 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
CDK13Q14004 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
CDK13Q14004 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
CDK13Q14004 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
CDK13Q14004 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
CDK13Q14004 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC33.62■■■□□ 2.97
CDK13Q14004 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
CDK13Q14004 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
CDK13Q14004 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
CDK13Q14004 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
CDK13Q14004 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
CDK13Q14004 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
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