Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDE6HQ13956 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDE6HQ13956 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDE6HQ13956 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDE6HQ13956 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDE6HQ13956 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDE6HQ13956 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDE6HQ13956 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDE6HQ13956 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDE6HQ13956 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDE6HQ13956 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDE6HQ13956 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDE6HQ13956 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDE6HQ13956 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDE6HQ13956 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PDE6HQ13956 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDE6HQ13956 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDE6HQ13956 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDE6HQ13956 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDE6HQ13956 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDE6HQ13956 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDE6HQ13956 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PDE6HQ13956 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PDE6HQ13956 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PDE6HQ13956 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PDE6HQ13956 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDE6HQ13956 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDE6HQ13956 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDE6HQ13956 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDE6HQ13956 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDE6HQ13956 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDE6HQ13956 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDE6HQ13956 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PDE6HQ13956 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDE6HQ13956 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDE6HQ13956 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDE6HQ13956 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDE6HQ13956 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
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PDE6HQ13956 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PDE6HQ13956 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
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PDE6HQ13956 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDE6HQ13956 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDE6HQ13956 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDE6HQ13956 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDE6HQ13956 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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PDE6HQ13956 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PDE6HQ13956 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PDE6HQ13956 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PDE6HQ13956 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PDE6HQ13956 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
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PDE6HQ13956 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PDE6HQ13956 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
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PDE6HQ13956 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
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PDE6HQ13956 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PDE6HQ13956 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PDE6HQ13956 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PDE6HQ13956 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
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PDE6HQ13956 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
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PDE6HQ13956 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PDE6HQ13956 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PDE6HQ13956 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
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PDE6HQ13956 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
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PDE6HQ13956 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PDE6HQ13956 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PDE6HQ13956 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PDE6HQ13956 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PDE6HQ13956 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PDE6HQ13956 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PDE6HQ13956 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PDE6HQ13956 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PDE6HQ13956 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PDE6HQ13956 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PDE6HQ13956 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PDE6HQ13956 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PDE6HQ13956 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PDE6HQ13956 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PDE6HQ13956 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PDE6HQ13956 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PDE6HQ13956 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PDE6HQ13956 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PDE6HQ13956 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PDE6HQ13956 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PDE6HQ13956 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PDE6HQ13956 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PDE6HQ13956 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PDE6HQ13956 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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