Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOFQ13790 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
APOFQ13790 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOFQ13790 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOFQ13790 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOFQ13790 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOFQ13790 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOFQ13790 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOFQ13790 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOFQ13790 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOFQ13790 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOFQ13790 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOFQ13790 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOFQ13790 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOFQ13790 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOFQ13790 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOFQ13790 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOFQ13790 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOFQ13790 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOFQ13790 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOFQ13790 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOFQ13790 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOFQ13790 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOFQ13790 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOFQ13790 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOFQ13790 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOFQ13790 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOFQ13790 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOFQ13790 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOFQ13790 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
APOFQ13790 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOFQ13790 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOFQ13790 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOFQ13790 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOFQ13790 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOFQ13790 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOFQ13790 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
APOFQ13790 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOFQ13790 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOFQ13790 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOFQ13790 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOFQ13790 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOFQ13790 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOFQ13790 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOFQ13790 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOFQ13790 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOFQ13790 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOFQ13790 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOFQ13790 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOFQ13790 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOFQ13790 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOFQ13790 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOFQ13790 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOFQ13790 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOFQ13790 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOFQ13790 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOFQ13790 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOFQ13790 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOFQ13790 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOFQ13790 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOFQ13790 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOFQ13790 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOFQ13790 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOFQ13790 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOFQ13790 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOFQ13790 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
APOFQ13790 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
APOFQ13790 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
APOFQ13790 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
APOFQ13790 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
APOFQ13790 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
APOFQ13790 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
APOFQ13790 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
APOFQ13790 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
APOFQ13790 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
APOFQ13790 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
APOFQ13790 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
APOFQ13790 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
APOFQ13790 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOFQ13790 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOFQ13790 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOFQ13790 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOFQ13790 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
APOFQ13790 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOFQ13790 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOFQ13790 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
APOFQ13790 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOFQ13790 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOFQ13790 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOFQ13790 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOFQ13790 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOFQ13790 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOFQ13790 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOFQ13790 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOFQ13790 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOFQ13790 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOFQ13790 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
APOFQ13790 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
APOFQ13790 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
APOFQ13790 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
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