Protein–RNA interactions for Protein: Q13613

MTMR1, Myotubularin-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR1Q13613 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MTMR1Q13613 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MTMR1Q13613 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MTMR1Q13613 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MTMR1Q13613 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MTMR1Q13613 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MTMR1Q13613 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MTMR1Q13613 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MTMR1Q13613 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MTMR1Q13613 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MTMR1Q13613 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MTMR1Q13613 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MTMR1Q13613 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MTMR1Q13613 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MTMR1Q13613 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MTMR1Q13613 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MTMR1Q13613 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MTMR1Q13613 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MTMR1Q13613 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MTMR1Q13613 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MTMR1Q13613 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MTMR1Q13613 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MTMR1Q13613 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MTMR1Q13613 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MTMR1Q13613 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MTMR1Q13613 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MTMR1Q13613 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
MTMR1Q13613 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MTMR1Q13613 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MTMR1Q13613 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
MTMR1Q13613 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MTMR1Q13613 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MTMR1Q13613 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MTMR1Q13613 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MTMR1Q13613 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MTMR1Q13613 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MTMR1Q13613 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
MTMR1Q13613 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MTMR1Q13613 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MTMR1Q13613 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MTMR1Q13613 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MTMR1Q13613 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MTMR1Q13613 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MTMR1Q13613 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
MTMR1Q13613 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MTMR1Q13613 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MTMR1Q13613 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
MTMR1Q13613 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
MTMR1Q13613 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MTMR1Q13613 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MTMR1Q13613 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MTMR1Q13613 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MTMR1Q13613 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MTMR1Q13613 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MTMR1Q13613 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MTMR1Q13613 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MTMR1Q13613 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MTMR1Q13613 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MTMR1Q13613 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MTMR1Q13613 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MTMR1Q13613 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MTMR1Q13613 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MTMR1Q13613 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MTMR1Q13613 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MTMR1Q13613 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MTMR1Q13613 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MTMR1Q13613 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MTMR1Q13613 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MTMR1Q13613 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MTMR1Q13613 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MTMR1Q13613 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MTMR1Q13613 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MTMR1Q13613 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MTMR1Q13613 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MTMR1Q13613 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MTMR1Q13613 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MTMR1Q13613 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MTMR1Q13613 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MTMR1Q13613 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MTMR1Q13613 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MTMR1Q13613 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MTMR1Q13613 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MTMR1Q13613 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MTMR1Q13613 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MTMR1Q13613 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MTMR1Q13613 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MTMR1Q13613 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MTMR1Q13613 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MTMR1Q13613 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MTMR1Q13613 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MTMR1Q13613 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MTMR1Q13613 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MTMR1Q13613 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MTMR1Q13613 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MTMR1Q13613 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
MTMR1Q13613 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MTMR1Q13613 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MTMR1Q13613 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MTMR1Q13613 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MTMR1Q13613 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
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