Protein–RNA interactions for Protein: Q13541

EIF4EBP1, Eukaryotic translation initiation factor 4E-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4EBP1Q13541 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EIF4EBP1Q13541 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EIF4EBP1Q13541 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EIF4EBP1Q13541 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EIF4EBP1Q13541 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EIF4EBP1Q13541 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EIF4EBP1Q13541 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EIF4EBP1Q13541 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EIF4EBP1Q13541 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EIF4EBP1Q13541 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EIF4EBP1Q13541 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EIF4EBP1Q13541 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EIF4EBP1Q13541 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EIF4EBP1Q13541 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EIF4EBP1Q13541 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EIF4EBP1Q13541 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
EIF4EBP1Q13541 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EIF4EBP1Q13541 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EIF4EBP1Q13541 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EIF4EBP1Q13541 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
EIF4EBP1Q13541 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EIF4EBP1Q13541 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EIF4EBP1Q13541 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EIF4EBP1Q13541 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EIF4EBP1Q13541 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EIF4EBP1Q13541 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EIF4EBP1Q13541 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EIF4EBP1Q13541 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EIF4EBP1Q13541 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
EIF4EBP1Q13541 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EIF4EBP1Q13541 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EIF4EBP1Q13541 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EIF4EBP1Q13541 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EIF4EBP1Q13541 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
EIF4EBP1Q13541 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
EIF4EBP1Q13541 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EIF4EBP1Q13541 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
EIF4EBP1Q13541 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EIF4EBP1Q13541 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EIF4EBP1Q13541 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EIF4EBP1Q13541 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EIF4EBP1Q13541 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EIF4EBP1Q13541 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EIF4EBP1Q13541 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EIF4EBP1Q13541 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
EIF4EBP1Q13541 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EIF4EBP1Q13541 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EIF4EBP1Q13541 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EIF4EBP1Q13541 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EIF4EBP1Q13541 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EIF4EBP1Q13541 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EIF4EBP1Q13541 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EIF4EBP1Q13541 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EIF4EBP1Q13541 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EIF4EBP1Q13541 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EIF4EBP1Q13541 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EIF4EBP1Q13541 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EIF4EBP1Q13541 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EIF4EBP1Q13541 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EIF4EBP1Q13541 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EIF4EBP1Q13541 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EIF4EBP1Q13541 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EIF4EBP1Q13541 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
EIF4EBP1Q13541 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EIF4EBP1Q13541 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
EIF4EBP1Q13541 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EIF4EBP1Q13541 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EIF4EBP1Q13541 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EIF4EBP1Q13541 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EIF4EBP1Q13541 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EIF4EBP1Q13541 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EIF4EBP1Q13541 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
EIF4EBP1Q13541 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EIF4EBP1Q13541 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EIF4EBP1Q13541 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EIF4EBP1Q13541 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EIF4EBP1Q13541 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EIF4EBP1Q13541 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EIF4EBP1Q13541 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EIF4EBP1Q13541 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
EIF4EBP1Q13541 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EIF4EBP1Q13541 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EIF4EBP1Q13541 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EIF4EBP1Q13541 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EIF4EBP1Q13541 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EIF4EBP1Q13541 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EIF4EBP1Q13541 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EIF4EBP1Q13541 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EIF4EBP1Q13541 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EIF4EBP1Q13541 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EIF4EBP1Q13541 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EIF4EBP1Q13541 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EIF4EBP1Q13541 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EIF4EBP1Q13541 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EIF4EBP1Q13541 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EIF4EBP1Q13541 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EIF4EBP1Q13541 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EIF4EBP1Q13541 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EIF4EBP1Q13541 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EIF4EBP1Q13541 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms