Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ATRQ13535 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ATRQ13535 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATRQ13535 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATRQ13535 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATRQ13535 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATRQ13535 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATRQ13535 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATRQ13535 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATRQ13535 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATRQ13535 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATRQ13535 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ATRQ13535 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ATRQ13535 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATRQ13535 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATRQ13535 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATRQ13535 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATRQ13535 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATRQ13535 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATRQ13535 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATRQ13535 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATRQ13535 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATRQ13535 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATRQ13535 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATRQ13535 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATRQ13535 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATRQ13535 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATRQ13535 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATRQ13535 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATRQ13535 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATRQ13535 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATRQ13535 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATRQ13535 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATRQ13535 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATRQ13535 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATRQ13535 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATRQ13535 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ATRQ13535 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATRQ13535 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATRQ13535 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATRQ13535 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATRQ13535 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATRQ13535 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATRQ13535 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATRQ13535 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATRQ13535 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATRQ13535 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATRQ13535 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATRQ13535 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATRQ13535 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATRQ13535 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATRQ13535 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATRQ13535 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATRQ13535 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATRQ13535 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATRQ13535 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ATRQ13535 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATRQ13535 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATRQ13535 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATRQ13535 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATRQ13535 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATRQ13535 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATRQ13535 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATRQ13535 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATRQ13535 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ATRQ13535 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATRQ13535 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATRQ13535 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATRQ13535 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATRQ13535 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATRQ13535 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATRQ13535 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATRQ13535 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATRQ13535 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATRQ13535 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATRQ13535 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATRQ13535 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATRQ13535 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATRQ13535 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATRQ13535 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATRQ13535 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
ATRQ13535 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATRQ13535 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATRQ13535 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATRQ13535 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATRQ13535 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATRQ13535 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATRQ13535 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATRQ13535 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATRQ13535 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATRQ13535 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATRQ13535 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATRQ13535 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATRQ13535 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATRQ13535 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATRQ13535 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATRQ13535 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATRQ13535 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATRQ13535 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATRQ13535 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
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