Protein–RNA interactions for Protein: Q13131

PRKAA1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAA1Q13131 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRKAA1Q13131 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRKAA1Q13131 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRKAA1Q13131 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRKAA1Q13131 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRKAA1Q13131 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRKAA1Q13131 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRKAA1Q13131 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRKAA1Q13131 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRKAA1Q13131 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRKAA1Q13131 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRKAA1Q13131 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRKAA1Q13131 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRKAA1Q13131 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRKAA1Q13131 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRKAA1Q13131 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRKAA1Q13131 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRKAA1Q13131 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRKAA1Q13131 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRKAA1Q13131 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRKAA1Q13131 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PRKAA1Q13131 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRKAA1Q13131 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRKAA1Q13131 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRKAA1Q13131 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRKAA1Q13131 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRKAA1Q13131 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRKAA1Q13131 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRKAA1Q13131 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRKAA1Q13131 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRKAA1Q13131 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRKAA1Q13131 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRKAA1Q13131 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRKAA1Q13131 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRKAA1Q13131 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRKAA1Q13131 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRKAA1Q13131 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRKAA1Q13131 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRKAA1Q13131 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRKAA1Q13131 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRKAA1Q13131 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRKAA1Q13131 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRKAA1Q13131 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRKAA1Q13131 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRKAA1Q13131 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PRKAA1Q13131 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRKAA1Q13131 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRKAA1Q13131 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRKAA1Q13131 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRKAA1Q13131 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRKAA1Q13131 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRKAA1Q13131 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRKAA1Q13131 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRKAA1Q13131 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRKAA1Q13131 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRKAA1Q13131 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRKAA1Q13131 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRKAA1Q13131 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRKAA1Q13131 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRKAA1Q13131 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRKAA1Q13131 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRKAA1Q13131 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKAA1Q13131 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKAA1Q13131 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKAA1Q13131 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKAA1Q13131 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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PRKAA1Q13131 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKAA1Q13131 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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PRKAA1Q13131 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKAA1Q13131 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKAA1Q13131 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKAA1Q13131 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKAA1Q13131 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKAA1Q13131 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKAA1Q13131 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKAA1Q13131 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRKAA1Q13131 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRKAA1Q13131 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRKAA1Q13131 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRKAA1Q13131 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRKAA1Q13131 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRKAA1Q13131 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRKAA1Q13131 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRKAA1Q13131 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRKAA1Q13131 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PRKAA1Q13131 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PRKAA1Q13131 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRKAA1Q13131 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRKAA1Q13131 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRKAA1Q13131 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRKAA1Q13131 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRKAA1Q13131 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRKAA1Q13131 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRKAA1Q13131 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
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