Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DUSP4Q13115 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DUSP4Q13115 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DUSP4Q13115 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DUSP4Q13115 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DUSP4Q13115 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DUSP4Q13115 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DUSP4Q13115 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DUSP4Q13115 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DUSP4Q13115 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DUSP4Q13115 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DUSP4Q13115 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DUSP4Q13115 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
DUSP4Q13115 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DUSP4Q13115 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DUSP4Q13115 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DUSP4Q13115 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DUSP4Q13115 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DUSP4Q13115 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DUSP4Q13115 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DUSP4Q13115 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DUSP4Q13115 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DUSP4Q13115 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DUSP4Q13115 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DUSP4Q13115 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
DUSP4Q13115 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DUSP4Q13115 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DUSP4Q13115 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DUSP4Q13115 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DUSP4Q13115 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DUSP4Q13115 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DUSP4Q13115 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DUSP4Q13115 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
DUSP4Q13115 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DUSP4Q13115 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DUSP4Q13115 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DUSP4Q13115 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DUSP4Q13115 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DUSP4Q13115 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DUSP4Q13115 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DUSP4Q13115 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DUSP4Q13115 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DUSP4Q13115 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DUSP4Q13115 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DUSP4Q13115 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DUSP4Q13115 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DUSP4Q13115 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DUSP4Q13115 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DUSP4Q13115 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DUSP4Q13115 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DUSP4Q13115 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DUSP4Q13115 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DUSP4Q13115 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DUSP4Q13115 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DUSP4Q13115 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DUSP4Q13115 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DUSP4Q13115 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DUSP4Q13115 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DUSP4Q13115 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DUSP4Q13115 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DUSP4Q13115 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
DUSP4Q13115 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DUSP4Q13115 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DUSP4Q13115 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DUSP4Q13115 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DUSP4Q13115 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
DUSP4Q13115 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DUSP4Q13115 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DUSP4Q13115 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
DUSP4Q13115 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DUSP4Q13115 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DUSP4Q13115 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DUSP4Q13115 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
DUSP4Q13115 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
DUSP4Q13115 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DUSP4Q13115 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DUSP4Q13115 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DUSP4Q13115 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DUSP4Q13115 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DUSP4Q13115 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DUSP4Q13115 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DUSP4Q13115 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DUSP4Q13115 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DUSP4Q13115 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DUSP4Q13115 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DUSP4Q13115 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DUSP4Q13115 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DUSP4Q13115 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DUSP4Q13115 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DUSP4Q13115 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DUSP4Q13115 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DUSP4Q13115 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DUSP4Q13115 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DUSP4Q13115 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DUSP4Q13115 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DUSP4Q13115 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DUSP4Q13115 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DUSP4Q13115 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DUSP4Q13115 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DUSP4Q13115 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
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