Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
PRDM2Q13029 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
PRDM2Q13029 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
PRDM2Q13029 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
PRDM2Q13029 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
PRDM2Q13029 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
PRDM2Q13029 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
PRDM2Q13029 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC37.22■■■■□ 3.55
PRDM2Q13029 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.22■■■■□ 3.55
PRDM2Q13029 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
PRDM2Q13029 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC37.22■■■■□ 3.55
PRDM2Q13029 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
PRDM2Q13029 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
PRDM2Q13029 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
PRDM2Q13029 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
PRDM2Q13029 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
PRDM2Q13029 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC37.22■■■■□ 3.55
PRDM2Q13029 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC37.22■■■■□ 3.55
PRDM2Q13029 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
PRDM2Q13029 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
PRDM2Q13029 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
PRDM2Q13029 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
PRDM2Q13029 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
PRDM2Q13029 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
PRDM2Q13029 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC37.21■■■■□ 3.55
PRDM2Q13029 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.21■■■■□ 3.55
PRDM2Q13029 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
PRDM2Q13029 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC37.21■■■■□ 3.55
PRDM2Q13029 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
PRDM2Q13029 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
PRDM2Q13029 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
PRDM2Q13029 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC37.2■■■■□ 3.55
PRDM2Q13029 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
PRDM2Q13029 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
PRDM2Q13029 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
PRDM2Q13029 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
PRDM2Q13029 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
PRDM2Q13029 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC37.19■■■■□ 3.54
PRDM2Q13029 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.19■■■■□ 3.54
PRDM2Q13029 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
PRDM2Q13029 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC37.19■■■■□ 3.54
PRDM2Q13029 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC37.19■■■■□ 3.54
PRDM2Q13029 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
PRDM2Q13029 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
PRDM2Q13029 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
PRDM2Q13029 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
PRDM2Q13029 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
PRDM2Q13029 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
PRDM2Q13029 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
PRDM2Q13029 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC37.17■■■■□ 3.54
PRDM2Q13029 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC37.17■■■■□ 3.54
PRDM2Q13029 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC37.17■■■■□ 3.54
PRDM2Q13029 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC37.17■■■■□ 3.54
PRDM2Q13029 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
PRDM2Q13029 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
PRDM2Q13029 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC37.17■■■■□ 3.54
PRDM2Q13029 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
PRDM2Q13029 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC37.17■■■■□ 3.54
PRDM2Q13029 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC37.16■■■■□ 3.54
PRDM2Q13029 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC37.16■■■■□ 3.54
PRDM2Q13029 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC37.16■■■■□ 3.54
PRDM2Q13029 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
PRDM2Q13029 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
PRDM2Q13029 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.16■■■■□ 3.54
PRDM2Q13029 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
PRDM2Q13029 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
PRDM2Q13029 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
PRDM2Q13029 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC37.16■■■■□ 3.54
PRDM2Q13029 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC37.16■■■■□ 3.54
PRDM2Q13029 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
PRDM2Q13029 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC37.15■■■■□ 3.54
PRDM2Q13029 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.15■■■■□ 3.54
PRDM2Q13029 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
PRDM2Q13029 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
PRDM2Q13029 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
PRDM2Q13029 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.15■■■■□ 3.54
PRDM2Q13029 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC37.15■■■■□ 3.54
PRDM2Q13029 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
PRDM2Q13029 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
PRDM2Q13029 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
PRDM2Q13029 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
PRDM2Q13029 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
PRDM2Q13029 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
PRDM2Q13029 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC37.14■■■■□ 3.54
PRDM2Q13029 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC37.14■■■■□ 3.54
PRDM2Q13029 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC37.14■■■■□ 3.54
PRDM2Q13029 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC37.14■■■■□ 3.54
PRDM2Q13029 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC37.14■■■■□ 3.54
PRDM2Q13029 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC37.14■■■■□ 3.54
PRDM2Q13029 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC37.14■■■■□ 3.54
PRDM2Q13029 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
PRDM2Q13029 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC37.13■■■■□ 3.53
PRDM2Q13029 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
PRDM2Q13029 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
PRDM2Q13029 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC37.13■■■■□ 3.53
PRDM2Q13029 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
PRDM2Q13029 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
PRDM2Q13029 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC37.13■■■■□ 3.53
PRDM2Q13029 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
PRDM2Q13029 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC37.13■■■■□ 3.53
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