Protein–RNA interactions for Protein: Q13011

ECH1, Delta(3,5)-Delta(2,4)-dienoyl-CoA isomerase, mitochondrial, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECH1Q13011 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ECH1Q13011 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ECH1Q13011 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ECH1Q13011 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ECH1Q13011 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ECH1Q13011 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ECH1Q13011 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ECH1Q13011 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ECH1Q13011 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ECH1Q13011 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ECH1Q13011 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ECH1Q13011 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ECH1Q13011 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ECH1Q13011 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ECH1Q13011 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ECH1Q13011 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ECH1Q13011 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ECH1Q13011 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ECH1Q13011 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ECH1Q13011 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ECH1Q13011 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ECH1Q13011 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ECH1Q13011 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ECH1Q13011 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ECH1Q13011 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ECH1Q13011 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ECH1Q13011 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ECH1Q13011 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ECH1Q13011 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ECH1Q13011 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ECH1Q13011 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ECH1Q13011 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ECH1Q13011 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ECH1Q13011 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ECH1Q13011 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ECH1Q13011 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ECH1Q13011 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ECH1Q13011 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ECH1Q13011 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ECH1Q13011 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ECH1Q13011 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ECH1Q13011 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ECH1Q13011 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ECH1Q13011 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ECH1Q13011 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ECH1Q13011 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ECH1Q13011 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ECH1Q13011 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ECH1Q13011 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ECH1Q13011 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ECH1Q13011 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ECH1Q13011 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ECH1Q13011 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ECH1Q13011 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ECH1Q13011 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ECH1Q13011 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ECH1Q13011 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ECH1Q13011 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ECH1Q13011 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ECH1Q13011 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ECH1Q13011 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ECH1Q13011 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ECH1Q13011 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ECH1Q13011 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ECH1Q13011 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ECH1Q13011 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ECH1Q13011 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ECH1Q13011 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ECH1Q13011 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ECH1Q13011 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ECH1Q13011 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ECH1Q13011 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ECH1Q13011 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ECH1Q13011 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ECH1Q13011 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ECH1Q13011 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ECH1Q13011 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ECH1Q13011 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ECH1Q13011 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ECH1Q13011 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ECH1Q13011 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ECH1Q13011 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ECH1Q13011 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ECH1Q13011 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ECH1Q13011 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ECH1Q13011 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ECH1Q13011 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ECH1Q13011 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ECH1Q13011 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ECH1Q13011 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ECH1Q13011 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
ECH1Q13011 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ECH1Q13011 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ECH1Q13011 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ECH1Q13011 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ECH1Q13011 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ECH1Q13011 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ECH1Q13011 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ECH1Q13011 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ECH1Q13011 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
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