Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CSTF3Q12996 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CSTF3Q12996 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CSTF3Q12996 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CSTF3Q12996 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CSTF3Q12996 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CSTF3Q12996 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CSTF3Q12996 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CSTF3Q12996 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CSTF3Q12996 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CSTF3Q12996 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CSTF3Q12996 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CSTF3Q12996 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CSTF3Q12996 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CSTF3Q12996 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CSTF3Q12996 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CSTF3Q12996 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CSTF3Q12996 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CSTF3Q12996 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CSTF3Q12996 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CSTF3Q12996 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CSTF3Q12996 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CSTF3Q12996 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CSTF3Q12996 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CSTF3Q12996 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CSTF3Q12996 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CSTF3Q12996 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CSTF3Q12996 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CSTF3Q12996 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CSTF3Q12996 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CSTF3Q12996 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CSTF3Q12996 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CSTF3Q12996 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CSTF3Q12996 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CSTF3Q12996 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CSTF3Q12996 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CSTF3Q12996 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CSTF3Q12996 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CSTF3Q12996 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CSTF3Q12996 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CSTF3Q12996 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CSTF3Q12996 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CSTF3Q12996 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CSTF3Q12996 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CSTF3Q12996 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CSTF3Q12996 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CSTF3Q12996 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CSTF3Q12996 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CSTF3Q12996 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CSTF3Q12996 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CSTF3Q12996 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CSTF3Q12996 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CSTF3Q12996 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CSTF3Q12996 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CSTF3Q12996 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CSTF3Q12996 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CSTF3Q12996 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CSTF3Q12996 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CSTF3Q12996 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CSTF3Q12996 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CSTF3Q12996 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CSTF3Q12996 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CSTF3Q12996 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CSTF3Q12996 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CSTF3Q12996 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CSTF3Q12996 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CSTF3Q12996 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CSTF3Q12996 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CSTF3Q12996 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CSTF3Q12996 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CSTF3Q12996 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CSTF3Q12996 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CSTF3Q12996 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CSTF3Q12996 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CSTF3Q12996 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CSTF3Q12996 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CSTF3Q12996 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CSTF3Q12996 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CSTF3Q12996 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CSTF3Q12996 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CSTF3Q12996 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CSTF3Q12996 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CSTF3Q12996 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CSTF3Q12996 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CSTF3Q12996 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CSTF3Q12996 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CSTF3Q12996 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CSTF3Q12996 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CSTF3Q12996 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CSTF3Q12996 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CSTF3Q12996 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CSTF3Q12996 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CSTF3Q12996 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CSTF3Q12996 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CSTF3Q12996 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CSTF3Q12996 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.91
CSTF3Q12996 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
CSTF3Q12996 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.91
CSTF3Q12996 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CSTF3Q12996 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
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