Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FOXF1Q12946 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FOXF1Q12946 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FOXF1Q12946 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FOXF1Q12946 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FOXF1Q12946 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FOXF1Q12946 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FOXF1Q12946 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FOXF1Q12946 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FOXF1Q12946 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FOXF1Q12946 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FOXF1Q12946 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FOXF1Q12946 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FOXF1Q12946 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FOXF1Q12946 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FOXF1Q12946 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FOXF1Q12946 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FOXF1Q12946 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FOXF1Q12946 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FOXF1Q12946 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FOXF1Q12946 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FOXF1Q12946 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FOXF1Q12946 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FOXF1Q12946 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FOXF1Q12946 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FOXF1Q12946 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FOXF1Q12946 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FOXF1Q12946 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FOXF1Q12946 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FOXF1Q12946 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FOXF1Q12946 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FOXF1Q12946 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FOXF1Q12946 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
FOXF1Q12946 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
FOXF1Q12946 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FOXF1Q12946 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FOXF1Q12946 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FOXF1Q12946 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
FOXF1Q12946 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
FOXF1Q12946 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FOXF1Q12946 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FOXF1Q12946 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FOXF1Q12946 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FOXF1Q12946 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FOXF1Q12946 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FOXF1Q12946 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FOXF1Q12946 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FOXF1Q12946 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FOXF1Q12946 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FOXF1Q12946 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FOXF1Q12946 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FOXF1Q12946 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FOXF1Q12946 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FOXF1Q12946 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FOXF1Q12946 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FOXF1Q12946 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FOXF1Q12946 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FOXF1Q12946 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FOXF1Q12946 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FOXF1Q12946 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FOXF1Q12946 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FOXF1Q12946 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FOXF1Q12946 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FOXF1Q12946 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FOXF1Q12946 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FOXF1Q12946 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FOXF1Q12946 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FOXF1Q12946 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FOXF1Q12946 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FOXF1Q12946 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FOXF1Q12946 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FOXF1Q12946 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FOXF1Q12946 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FOXF1Q12946 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FOXF1Q12946 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FOXF1Q12946 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FOXF1Q12946 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FOXF1Q12946 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
FOXF1Q12946 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FOXF1Q12946 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FOXF1Q12946 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FOXF1Q12946 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FOXF1Q12946 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FOXF1Q12946 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FOXF1Q12946 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FOXF1Q12946 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FOXF1Q12946 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FOXF1Q12946 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FOXF1Q12946 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FOXF1Q12946 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FOXF1Q12946 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FOXF1Q12946 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FOXF1Q12946 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FOXF1Q12946 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FOXF1Q12946 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FOXF1Q12946 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FOXF1Q12946 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FOXF1Q12946 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FOXF1Q12946 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FOXF1Q12946 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
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