Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRJQ12913 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRJQ12913 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRJQ12913 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRJQ12913 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRJQ12913 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRJQ12913 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRJQ12913 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRJQ12913 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRJQ12913 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRJQ12913 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRJQ12913 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRJQ12913 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRJQ12913 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRJQ12913 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRJQ12913 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRJQ12913 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRJQ12913 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRJQ12913 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRJQ12913 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRJQ12913 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRJQ12913 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRJQ12913 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRJQ12913 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRJQ12913 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRJQ12913 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRJQ12913 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRJQ12913 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRJQ12913 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRJQ12913 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRJQ12913 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRJQ12913 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRJQ12913 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRJQ12913 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRJQ12913 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRJQ12913 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRJQ12913 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRJQ12913 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRJQ12913 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRJQ12913 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRJQ12913 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRJQ12913 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRJQ12913 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRJQ12913 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRJQ12913 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRJQ12913 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRJQ12913 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRJQ12913 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRJQ12913 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRJQ12913 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRJQ12913 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRJQ12913 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRJQ12913 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRJQ12913 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRJQ12913 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRJQ12913 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRJQ12913 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRJQ12913 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRJQ12913 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRJQ12913 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRJQ12913 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRJQ12913 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRJQ12913 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRJQ12913 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRJQ12913 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRJQ12913 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRJQ12913 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRJQ12913 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRJQ12913 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRJQ12913 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRJQ12913 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRJQ12913 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRJQ12913 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRJQ12913 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRJQ12913 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRJQ12913 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRJQ12913 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRJQ12913 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRJQ12913 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRJQ12913 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRJQ12913 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRJQ12913 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRJQ12913 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRJQ12913 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRJQ12913 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRJQ12913 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRJQ12913 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRJQ12913 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRJQ12913 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRJQ12913 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRJQ12913 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRJQ12913 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRJQ12913 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRJQ12913 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRJQ12913 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRJQ12913 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRJQ12913 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRJQ12913 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRJQ12913 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRJQ12913 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
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