Protein–RNA interactions for Protein: Q12872

SFSWAP, Splicing factor, suppressor of white-apricot homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 951 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFSWAPQ12872 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SFSWAPQ12872 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SFSWAPQ12872 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SFSWAPQ12872 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SFSWAPQ12872 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SFSWAPQ12872 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SFSWAPQ12872 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SFSWAPQ12872 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SFSWAPQ12872 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SFSWAPQ12872 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SFSWAPQ12872 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SFSWAPQ12872 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SFSWAPQ12872 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SFSWAPQ12872 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SFSWAPQ12872 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SFSWAPQ12872 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SFSWAPQ12872 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SFSWAPQ12872 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SFSWAPQ12872 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SFSWAPQ12872 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SFSWAPQ12872 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SFSWAPQ12872 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SFSWAPQ12872 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SFSWAPQ12872 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SFSWAPQ12872 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SFSWAPQ12872 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SFSWAPQ12872 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SFSWAPQ12872 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SFSWAPQ12872 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SFSWAPQ12872 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SFSWAPQ12872 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SFSWAPQ12872 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SFSWAPQ12872 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SFSWAPQ12872 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SFSWAPQ12872 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SFSWAPQ12872 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SFSWAPQ12872 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SFSWAPQ12872 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SFSWAPQ12872 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SFSWAPQ12872 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SFSWAPQ12872 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SFSWAPQ12872 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SFSWAPQ12872 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SFSWAPQ12872 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SFSWAPQ12872 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SFSWAPQ12872 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SFSWAPQ12872 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SFSWAPQ12872 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SFSWAPQ12872 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SFSWAPQ12872 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SFSWAPQ12872 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SFSWAPQ12872 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SFSWAPQ12872 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SFSWAPQ12872 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SFSWAPQ12872 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SFSWAPQ12872 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SFSWAPQ12872 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SFSWAPQ12872 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SFSWAPQ12872 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SFSWAPQ12872 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SFSWAPQ12872 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SFSWAPQ12872 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SFSWAPQ12872 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SFSWAPQ12872 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SFSWAPQ12872 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SFSWAPQ12872 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SFSWAPQ12872 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SFSWAPQ12872 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SFSWAPQ12872 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SFSWAPQ12872 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SFSWAPQ12872 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SFSWAPQ12872 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SFSWAPQ12872 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SFSWAPQ12872 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SFSWAPQ12872 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SFSWAPQ12872 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SFSWAPQ12872 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SFSWAPQ12872 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SFSWAPQ12872 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SFSWAPQ12872 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SFSWAPQ12872 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SFSWAPQ12872 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SFSWAPQ12872 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SFSWAPQ12872 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SFSWAPQ12872 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SFSWAPQ12872 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SFSWAPQ12872 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SFSWAPQ12872 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SFSWAPQ12872 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SFSWAPQ12872 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SFSWAPQ12872 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SFSWAPQ12872 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SFSWAPQ12872 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SFSWAPQ12872 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SFSWAPQ12872 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SFSWAPQ12872 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SFSWAPQ12872 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SFSWAPQ12872 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SFSWAPQ12872 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SFSWAPQ12872 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
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