Protein–RNA interactions for Protein: Q12766

HMGXB3, HMG domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 1,538 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB3Q12766 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC38.59■■■■□ 3.77
HMGXB3Q12766 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC38.59■■■■□ 3.77
HMGXB3Q12766 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC38.59■■■■□ 3.77
HMGXB3Q12766 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.59■■■■□ 3.77
HMGXB3Q12766 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
HMGXB3Q12766 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
HMGXB3Q12766 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
HMGXB3Q12766 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC38.58■■■■□ 3.77
HMGXB3Q12766 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
HMGXB3Q12766 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC38.58■■■■□ 3.77
HMGXB3Q12766 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC38.58■■■■□ 3.77
HMGXB3Q12766 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC38.58■■■■□ 3.77
HMGXB3Q12766 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
HMGXB3Q12766 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
HMGXB3Q12766 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
HMGXB3Q12766 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC38.58■■■■□ 3.77
HMGXB3Q12766 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC38.58■■■■□ 3.77
HMGXB3Q12766 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
HMGXB3Q12766 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.58■■■■□ 3.77
HMGXB3Q12766 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC38.58■■■■□ 3.77
HMGXB3Q12766 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC38.57■■■■□ 3.77
HMGXB3Q12766 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.57■■■■□ 3.77
HMGXB3Q12766 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.77
HMGXB3Q12766 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.57■■■■□ 3.76
HMGXB3Q12766 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
HMGXB3Q12766 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC38.57■■■■□ 3.76
HMGXB3Q12766 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
HMGXB3Q12766 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
HMGXB3Q12766 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC38.56■■■■□ 3.76
HMGXB3Q12766 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC38.56■■■■□ 3.76
HMGXB3Q12766 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
HMGXB3Q12766 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
HMGXB3Q12766 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC38.55■■■■□ 3.76
HMGXB3Q12766 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC38.55■■■■□ 3.76
HMGXB3Q12766 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC38.55■■■■□ 3.76
HMGXB3Q12766 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC38.55■■■■□ 3.76
HMGXB3Q12766 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC38.55■■■■□ 3.76
HMGXB3Q12766 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
HMGXB3Q12766 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
HMGXB3Q12766 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
HMGXB3Q12766 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
HMGXB3Q12766 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC38.53■■■■□ 3.76
HMGXB3Q12766 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC38.53■■■■□ 3.76
HMGXB3Q12766 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC38.53■■■■□ 3.76
HMGXB3Q12766 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
HMGXB3Q12766 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC38.53■■■■□ 3.76
HMGXB3Q12766 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
HMGXB3Q12766 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.53■■■■□ 3.76
HMGXB3Q12766 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC38.53■■■■□ 3.76
HMGXB3Q12766 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
HMGXB3Q12766 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
HMGXB3Q12766 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
HMGXB3Q12766 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC38.53■■■■□ 3.76
HMGXB3Q12766 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC38.52■■■■□ 3.76
HMGXB3Q12766 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
HMGXB3Q12766 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
HMGXB3Q12766 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
HMGXB3Q12766 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
HMGXB3Q12766 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC38.52■■■■□ 3.76
HMGXB3Q12766 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
HMGXB3Q12766 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.51■■■■□ 3.76
HMGXB3Q12766 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
HMGXB3Q12766 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
HMGXB3Q12766 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
HMGXB3Q12766 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
HMGXB3Q12766 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.51■■■■□ 3.76
HMGXB3Q12766 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC38.51■■■■□ 3.76
HMGXB3Q12766 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC38.51■■■■□ 3.76
HMGXB3Q12766 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC38.51■■■■□ 3.76
HMGXB3Q12766 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.75
HMGXB3Q12766 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC38.5■■■■□ 3.75
HMGXB3Q12766 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC38.5■■■■□ 3.75
HMGXB3Q12766 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC38.5■■■■□ 3.75
HMGXB3Q12766 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC38.5■■■■□ 3.75
HMGXB3Q12766 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC38.5■■■■□ 3.75
HMGXB3Q12766 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
HMGXB3Q12766 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
HMGXB3Q12766 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC38.49■■■■□ 3.75
HMGXB3Q12766 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC38.49■■■■□ 3.75
HMGXB3Q12766 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC38.49■■■■□ 3.75
HMGXB3Q12766 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.49■■■■□ 3.75
HMGXB3Q12766 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
HMGXB3Q12766 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC38.48■■■■□ 3.75
HMGXB3Q12766 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC38.48■■■■□ 3.75
HMGXB3Q12766 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
HMGXB3Q12766 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.48■■■■□ 3.75
HMGXB3Q12766 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC38.48■■■■□ 3.75
HMGXB3Q12766 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC38.48■■■■□ 3.75
HMGXB3Q12766 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC38.48■■■■□ 3.75
HMGXB3Q12766 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC38.47■■■■□ 3.75
HMGXB3Q12766 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
HMGXB3Q12766 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC38.47■■■■□ 3.75
HMGXB3Q12766 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
HMGXB3Q12766 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
HMGXB3Q12766 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC38.46■■■■□ 3.75
HMGXB3Q12766 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
HMGXB3Q12766 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC38.46■■■■□ 3.75
HMGXB3Q12766 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC38.46■■■■□ 3.75
HMGXB3Q12766 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
HMGXB3Q12766 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC38.46■■■■□ 3.75
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