Protein–RNA interactions for Protein: Q10472

GALNT1, Polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALNT1Q10472 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GALNT1Q10472 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GALNT1Q10472 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GALNT1Q10472 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
GALNT1Q10472 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GALNT1Q10472 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GALNT1Q10472 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GALNT1Q10472 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GALNT1Q10472 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GALNT1Q10472 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GALNT1Q10472 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GALNT1Q10472 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
GALNT1Q10472 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
GALNT1Q10472 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
GALNT1Q10472 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
GALNT1Q10472 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GALNT1Q10472 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GALNT1Q10472 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GALNT1Q10472 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
GALNT1Q10472 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GALNT1Q10472 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GALNT1Q10472 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GALNT1Q10472 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GALNT1Q10472 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GALNT1Q10472 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GALNT1Q10472 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GALNT1Q10472 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GALNT1Q10472 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
GALNT1Q10472 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GALNT1Q10472 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GALNT1Q10472 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GALNT1Q10472 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GALNT1Q10472 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GALNT1Q10472 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GALNT1Q10472 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GALNT1Q10472 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GALNT1Q10472 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GALNT1Q10472 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GALNT1Q10472 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GALNT1Q10472 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GALNT1Q10472 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GALNT1Q10472 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GALNT1Q10472 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GALNT1Q10472 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
GALNT1Q10472 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GALNT1Q10472 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GALNT1Q10472 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GALNT1Q10472 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GALNT1Q10472 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GALNT1Q10472 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GALNT1Q10472 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GALNT1Q10472 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GALNT1Q10472 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
GALNT1Q10472 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GALNT1Q10472 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GALNT1Q10472 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GALNT1Q10472 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GALNT1Q10472 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
GALNT1Q10472 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GALNT1Q10472 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GALNT1Q10472 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GALNT1Q10472 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GALNT1Q10472 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GALNT1Q10472 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GALNT1Q10472 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GALNT1Q10472 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
GALNT1Q10472 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GALNT1Q10472 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GALNT1Q10472 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GALNT1Q10472 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
GALNT1Q10472 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GALNT1Q10472 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GALNT1Q10472 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GALNT1Q10472 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GALNT1Q10472 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GALNT1Q10472 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GALNT1Q10472 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GALNT1Q10472 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GALNT1Q10472 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GALNT1Q10472 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GALNT1Q10472 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GALNT1Q10472 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GALNT1Q10472 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GALNT1Q10472 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GALNT1Q10472 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GALNT1Q10472 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GALNT1Q10472 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GALNT1Q10472 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GALNT1Q10472 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GALNT1Q10472 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GALNT1Q10472 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GALNT1Q10472 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
GALNT1Q10472 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GALNT1Q10472 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GALNT1Q10472 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GALNT1Q10472 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GALNT1Q10472 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GALNT1Q10472 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GALNT1Q10472 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GALNT1Q10472 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms