Protein–RNA interactions for Protein: Q0P140

HSD52, Putative uncharacterized protein HSD52, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD52Q0P140 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
HSD52Q0P140 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HSD52Q0P140 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HSD52Q0P140 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HSD52Q0P140 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HSD52Q0P140 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HSD52Q0P140 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HSD52Q0P140 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HSD52Q0P140 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HSD52Q0P140 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HSD52Q0P140 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HSD52Q0P140 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HSD52Q0P140 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HSD52Q0P140 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HSD52Q0P140 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HSD52Q0P140 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HSD52Q0P140 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HSD52Q0P140 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HSD52Q0P140 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HSD52Q0P140 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HSD52Q0P140 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HSD52Q0P140 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HSD52Q0P140 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HSD52Q0P140 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HSD52Q0P140 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HSD52Q0P140 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HSD52Q0P140 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HSD52Q0P140 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HSD52Q0P140 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HSD52Q0P140 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HSD52Q0P140 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HSD52Q0P140 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HSD52Q0P140 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HSD52Q0P140 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HSD52Q0P140 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HSD52Q0P140 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HSD52Q0P140 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HSD52Q0P140 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HSD52Q0P140 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HSD52Q0P140 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HSD52Q0P140 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HSD52Q0P140 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HSD52Q0P140 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HSD52Q0P140 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HSD52Q0P140 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HSD52Q0P140 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HSD52Q0P140 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HSD52Q0P140 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HSD52Q0P140 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HSD52Q0P140 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HSD52Q0P140 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HSD52Q0P140 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HSD52Q0P140 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HSD52Q0P140 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HSD52Q0P140 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
HSD52Q0P140 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
HSD52Q0P140 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HSD52Q0P140 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
HSD52Q0P140 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HSD52Q0P140 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HSD52Q0P140 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HSD52Q0P140 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HSD52Q0P140 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
HSD52Q0P140 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HSD52Q0P140 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
HSD52Q0P140 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HSD52Q0P140 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HSD52Q0P140 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
HSD52Q0P140 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HSD52Q0P140 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HSD52Q0P140 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HSD52Q0P140 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
HSD52Q0P140 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HSD52Q0P140 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HSD52Q0P140 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HSD52Q0P140 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HSD52Q0P140 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HSD52Q0P140 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HSD52Q0P140 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HSD52Q0P140 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
HSD52Q0P140 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HSD52Q0P140 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HSD52Q0P140 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HSD52Q0P140 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
HSD52Q0P140 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HSD52Q0P140 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HSD52Q0P140 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HSD52Q0P140 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HSD52Q0P140 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HSD52Q0P140 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HSD52Q0P140 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HSD52Q0P140 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HSD52Q0P140 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC15□□□□□ -0.01
HSD52Q0P140 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HSD52Q0P140 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HSD52Q0P140 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HSD52Q0P140 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HSD52Q0P140 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HSD52Q0P140 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HSD52Q0P140 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms