Protein–RNA interactions for Protein: Q08ER8

ZNF543, Zinc finger protein 543, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF543Q08ER8 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF543Q08ER8 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF543Q08ER8 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF543Q08ER8 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF543Q08ER8 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF543Q08ER8 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF543Q08ER8 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF543Q08ER8 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF543Q08ER8 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF543Q08ER8 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF543Q08ER8 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF543Q08ER8 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF543Q08ER8 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF543Q08ER8 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF543Q08ER8 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF543Q08ER8 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF543Q08ER8 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF543Q08ER8 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF543Q08ER8 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF543Q08ER8 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF543Q08ER8 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF543Q08ER8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF543Q08ER8 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF543Q08ER8 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF543Q08ER8 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF543Q08ER8 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF543Q08ER8 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF543Q08ER8 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF543Q08ER8 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF543Q08ER8 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF543Q08ER8 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF543Q08ER8 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF543Q08ER8 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF543Q08ER8 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ZNF543Q08ER8 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
ZNF543Q08ER8 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ZNF543Q08ER8 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ZNF543Q08ER8 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZNF543Q08ER8 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZNF543Q08ER8 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZNF543Q08ER8 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF543Q08ER8 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF543Q08ER8 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF543Q08ER8 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF543Q08ER8 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF543Q08ER8 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF543Q08ER8 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF543Q08ER8 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF543Q08ER8 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF543Q08ER8 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF543Q08ER8 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF543Q08ER8 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF543Q08ER8 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF543Q08ER8 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF543Q08ER8 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF543Q08ER8 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF543Q08ER8 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF543Q08ER8 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF543Q08ER8 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF543Q08ER8 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF543Q08ER8 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF543Q08ER8 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF543Q08ER8 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF543Q08ER8 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF543Q08ER8 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF543Q08ER8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF543Q08ER8 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF543Q08ER8 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF543Q08ER8 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF543Q08ER8 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF543Q08ER8 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF543Q08ER8 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF543Q08ER8 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF543Q08ER8 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF543Q08ER8 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF543Q08ER8 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF543Q08ER8 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF543Q08ER8 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF543Q08ER8 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF543Q08ER8 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF543Q08ER8 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF543Q08ER8 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF543Q08ER8 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF543Q08ER8 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF543Q08ER8 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF543Q08ER8 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF543Q08ER8 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF543Q08ER8 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF543Q08ER8 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF543Q08ER8 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF543Q08ER8 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF543Q08ER8 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF543Q08ER8 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF543Q08ER8 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF543Q08ER8 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF543Q08ER8 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF543Q08ER8 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF543Q08ER8 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF543Q08ER8 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF543Q08ER8 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms