Protein–RNA interactions for Protein: Q08629

SPOCK1, Testican-1, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK1Q08629 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPOCK1Q08629 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPOCK1Q08629 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPOCK1Q08629 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPOCK1Q08629 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPOCK1Q08629 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPOCK1Q08629 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPOCK1Q08629 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPOCK1Q08629 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPOCK1Q08629 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPOCK1Q08629 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPOCK1Q08629 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPOCK1Q08629 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPOCK1Q08629 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPOCK1Q08629 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPOCK1Q08629 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPOCK1Q08629 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPOCK1Q08629 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPOCK1Q08629 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SPOCK1Q08629 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SPOCK1Q08629 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SPOCK1Q08629 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SPOCK1Q08629 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SPOCK1Q08629 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SPOCK1Q08629 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SPOCK1Q08629 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SPOCK1Q08629 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SPOCK1Q08629 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SPOCK1Q08629 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SPOCK1Q08629 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SPOCK1Q08629 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SPOCK1Q08629 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SPOCK1Q08629 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SPOCK1Q08629 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SPOCK1Q08629 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SPOCK1Q08629 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SPOCK1Q08629 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SPOCK1Q08629 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SPOCK1Q08629 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SPOCK1Q08629 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SPOCK1Q08629 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SPOCK1Q08629 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SPOCK1Q08629 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SPOCK1Q08629 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SPOCK1Q08629 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SPOCK1Q08629 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SPOCK1Q08629 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SPOCK1Q08629 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SPOCK1Q08629 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SPOCK1Q08629 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SPOCK1Q08629 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SPOCK1Q08629 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SPOCK1Q08629 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SPOCK1Q08629 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SPOCK1Q08629 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SPOCK1Q08629 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SPOCK1Q08629 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SPOCK1Q08629 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
SPOCK1Q08629 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SPOCK1Q08629 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SPOCK1Q08629 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SPOCK1Q08629 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SPOCK1Q08629 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SPOCK1Q08629 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SPOCK1Q08629 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SPOCK1Q08629 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SPOCK1Q08629 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SPOCK1Q08629 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SPOCK1Q08629 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SPOCK1Q08629 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SPOCK1Q08629 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SPOCK1Q08629 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SPOCK1Q08629 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SPOCK1Q08629 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPOCK1Q08629 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPOCK1Q08629 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPOCK1Q08629 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPOCK1Q08629 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPOCK1Q08629 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPOCK1Q08629 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPOCK1Q08629 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPOCK1Q08629 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPOCK1Q08629 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPOCK1Q08629 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPOCK1Q08629 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPOCK1Q08629 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPOCK1Q08629 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPOCK1Q08629 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPOCK1Q08629 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPOCK1Q08629 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPOCK1Q08629 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPOCK1Q08629 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPOCK1Q08629 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPOCK1Q08629 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPOCK1Q08629 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPOCK1Q08629 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPOCK1Q08629 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPOCK1Q08629 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPOCK1Q08629 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SPOCK1Q08629 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms