Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
GOLGA3Q08378 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
GOLGA3Q08378 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
GOLGA3Q08378 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
GOLGA3Q08378 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
GOLGA3Q08378 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
GOLGA3Q08378 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC35.16■■■■□ 3.22
GOLGA3Q08378 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
GOLGA3Q08378 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
GOLGA3Q08378 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
GOLGA3Q08378 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
GOLGA3Q08378 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
GOLGA3Q08378 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
GOLGA3Q08378 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
GOLGA3Q08378 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
GOLGA3Q08378 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC35.16■■■■□ 3.22
GOLGA3Q08378 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
GOLGA3Q08378 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
GOLGA3Q08378 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
GOLGA3Q08378 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC35.15■■■■□ 3.22
GOLGA3Q08378 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
GOLGA3Q08378 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC35.15■■■■□ 3.22
GOLGA3Q08378 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
GOLGA3Q08378 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
GOLGA3Q08378 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
GOLGA3Q08378 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
GOLGA3Q08378 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
GOLGA3Q08378 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
GOLGA3Q08378 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
GOLGA3Q08378 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
GOLGA3Q08378 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
GOLGA3Q08378 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
GOLGA3Q08378 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
GOLGA3Q08378 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
GOLGA3Q08378 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
GOLGA3Q08378 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
GOLGA3Q08378 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
GOLGA3Q08378 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
GOLGA3Q08378 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
GOLGA3Q08378 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
GOLGA3Q08378 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.12■■■■□ 3.21
GOLGA3Q08378 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
GOLGA3Q08378 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
GOLGA3Q08378 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
GOLGA3Q08378 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
GOLGA3Q08378 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
GOLGA3Q08378 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
GOLGA3Q08378 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
GOLGA3Q08378 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
GOLGA3Q08378 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
GOLGA3Q08378 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
GOLGA3Q08378 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
GOLGA3Q08378 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
GOLGA3Q08378 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
GOLGA3Q08378 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
GOLGA3Q08378 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
GOLGA3Q08378 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
GOLGA3Q08378 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC35.1■■■■□ 3.21
GOLGA3Q08378 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
GOLGA3Q08378 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
GOLGA3Q08378 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
GOLGA3Q08378 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
GOLGA3Q08378 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
GOLGA3Q08378 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
GOLGA3Q08378 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.09■■■■□ 3.21
GOLGA3Q08378 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC35.09■■■■□ 3.21
GOLGA3Q08378 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
GOLGA3Q08378 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
GOLGA3Q08378 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
GOLGA3Q08378 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
GOLGA3Q08378 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
GOLGA3Q08378 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC35.09■■■■□ 3.21
GOLGA3Q08378 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
GOLGA3Q08378 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
GOLGA3Q08378 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
GOLGA3Q08378 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC35.08■■■■□ 3.21
GOLGA3Q08378 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
GOLGA3Q08378 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
GOLGA3Q08378 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
GOLGA3Q08378 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC35.08■■■■□ 3.21
GOLGA3Q08378 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
GOLGA3Q08378 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
GOLGA3Q08378 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC35.08■■■■□ 3.21
GOLGA3Q08378 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
GOLGA3Q08378 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC35.08■■■■□ 3.21
GOLGA3Q08378 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.21
GOLGA3Q08378 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.21
GOLGA3Q08378 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC35.07■■■■□ 3.2
GOLGA3Q08378 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC35.07■■■■□ 3.2
GOLGA3Q08378 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
GOLGA3Q08378 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.2
GOLGA3Q08378 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
GOLGA3Q08378 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
GOLGA3Q08378 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
GOLGA3Q08378 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
GOLGA3Q08378 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
GOLGA3Q08378 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
GOLGA3Q08378 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
GOLGA3Q08378 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC35.05■■■■□ 3.2
GOLGA3Q08378 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms