Protein–RNA interactions for Protein: Q08043

ACTN3, Alpha-actinin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN3Q08043 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACTN3Q08043 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACTN3Q08043 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACTN3Q08043 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACTN3Q08043 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACTN3Q08043 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACTN3Q08043 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACTN3Q08043 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACTN3Q08043 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACTN3Q08043 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACTN3Q08043 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACTN3Q08043 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACTN3Q08043 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ACTN3Q08043 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACTN3Q08043 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACTN3Q08043 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACTN3Q08043 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACTN3Q08043 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACTN3Q08043 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACTN3Q08043 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACTN3Q08043 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACTN3Q08043 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACTN3Q08043 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACTN3Q08043 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACTN3Q08043 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACTN3Q08043 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACTN3Q08043 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACTN3Q08043 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACTN3Q08043 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACTN3Q08043 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACTN3Q08043 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACTN3Q08043 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACTN3Q08043 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACTN3Q08043 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACTN3Q08043 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACTN3Q08043 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACTN3Q08043 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACTN3Q08043 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACTN3Q08043 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACTN3Q08043 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACTN3Q08043 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACTN3Q08043 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ACTN3Q08043 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACTN3Q08043 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACTN3Q08043 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACTN3Q08043 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACTN3Q08043 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACTN3Q08043 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACTN3Q08043 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACTN3Q08043 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACTN3Q08043 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACTN3Q08043 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACTN3Q08043 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACTN3Q08043 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACTN3Q08043 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ACTN3Q08043 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACTN3Q08043 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACTN3Q08043 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACTN3Q08043 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACTN3Q08043 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACTN3Q08043 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACTN3Q08043 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACTN3Q08043 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACTN3Q08043 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACTN3Q08043 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACTN3Q08043 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACTN3Q08043 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACTN3Q08043 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACTN3Q08043 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACTN3Q08043 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ACTN3Q08043 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACTN3Q08043 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACTN3Q08043 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACTN3Q08043 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACTN3Q08043 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACTN3Q08043 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACTN3Q08043 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACTN3Q08043 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACTN3Q08043 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACTN3Q08043 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACTN3Q08043 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACTN3Q08043 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACTN3Q08043 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACTN3Q08043 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACTN3Q08043 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACTN3Q08043 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACTN3Q08043 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACTN3Q08043 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACTN3Q08043 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ACTN3Q08043 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACTN3Q08043 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACTN3Q08043 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACTN3Q08043 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACTN3Q08043 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACTN3Q08043 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACTN3Q08043 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACTN3Q08043 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACTN3Q08043 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACTN3Q08043 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ACTN3Q08043 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms