Protein–RNA interactions for Protein: Q07837

SLC3A1, Neutral and basic amino acid transport protein rBAT, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC3A1Q07837 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC3A1Q07837 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC3A1Q07837 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC3A1Q07837 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC3A1Q07837 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC3A1Q07837 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC3A1Q07837 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC3A1Q07837 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC3A1Q07837 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC3A1Q07837 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC3A1Q07837 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC3A1Q07837 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC3A1Q07837 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC3A1Q07837 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC3A1Q07837 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC3A1Q07837 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SLC3A1Q07837 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SLC3A1Q07837 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SLC3A1Q07837 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SLC3A1Q07837 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SLC3A1Q07837 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SLC3A1Q07837 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC3A1Q07837 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC3A1Q07837 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC3A1Q07837 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC3A1Q07837 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC3A1Q07837 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC3A1Q07837 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC3A1Q07837 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC3A1Q07837 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC3A1Q07837 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC3A1Q07837 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC3A1Q07837 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC3A1Q07837 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC3A1Q07837 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC3A1Q07837 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC3A1Q07837 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC3A1Q07837 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC3A1Q07837 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC3A1Q07837 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC3A1Q07837 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC3A1Q07837 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC3A1Q07837 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC3A1Q07837 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC3A1Q07837 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC3A1Q07837 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC3A1Q07837 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC3A1Q07837 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC3A1Q07837 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC3A1Q07837 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC3A1Q07837 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC3A1Q07837 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC3A1Q07837 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC3A1Q07837 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC3A1Q07837 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC3A1Q07837 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC3A1Q07837 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC3A1Q07837 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC3A1Q07837 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC3A1Q07837 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC3A1Q07837 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC3A1Q07837 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC3A1Q07837 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC3A1Q07837 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC3A1Q07837 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC3A1Q07837 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC3A1Q07837 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC3A1Q07837 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC3A1Q07837 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC3A1Q07837 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC3A1Q07837 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC3A1Q07837 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC3A1Q07837 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC3A1Q07837 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC3A1Q07837 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC3A1Q07837 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC3A1Q07837 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC3A1Q07837 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC3A1Q07837 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC3A1Q07837 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC3A1Q07837 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC3A1Q07837 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC3A1Q07837 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC3A1Q07837 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC3A1Q07837 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC3A1Q07837 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC3A1Q07837 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC3A1Q07837 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC3A1Q07837 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC3A1Q07837 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC3A1Q07837 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC3A1Q07837 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC3A1Q07837 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC3A1Q07837 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC3A1Q07837 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC3A1Q07837 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC3A1Q07837 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC3A1Q07837 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC3A1Q07837 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC3A1Q07837 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms