Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TFF3Q07654 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TFF3Q07654 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TFF3Q07654 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TFF3Q07654 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TFF3Q07654 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TFF3Q07654 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TFF3Q07654 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TFF3Q07654 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TFF3Q07654 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TFF3Q07654 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TFF3Q07654 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TFF3Q07654 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TFF3Q07654 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TFF3Q07654 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TFF3Q07654 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TFF3Q07654 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TFF3Q07654 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TFF3Q07654 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TFF3Q07654 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TFF3Q07654 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TFF3Q07654 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TFF3Q07654 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TFF3Q07654 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TFF3Q07654 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TFF3Q07654 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TFF3Q07654 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TFF3Q07654 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TFF3Q07654 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TFF3Q07654 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TFF3Q07654 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TFF3Q07654 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TFF3Q07654 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TFF3Q07654 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TFF3Q07654 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TFF3Q07654 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TFF3Q07654 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TFF3Q07654 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TFF3Q07654 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TFF3Q07654 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TFF3Q07654 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TFF3Q07654 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TFF3Q07654 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TFF3Q07654 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TFF3Q07654 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TFF3Q07654 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TFF3Q07654 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
TFF3Q07654 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
TFF3Q07654 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TFF3Q07654 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TFF3Q07654 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TFF3Q07654 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TFF3Q07654 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TFF3Q07654 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TFF3Q07654 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TFF3Q07654 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TFF3Q07654 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TFF3Q07654 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
TFF3Q07654 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TFF3Q07654 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TFF3Q07654 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TFF3Q07654 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TFF3Q07654 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TFF3Q07654 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TFF3Q07654 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TFF3Q07654 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TFF3Q07654 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TFF3Q07654 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TFF3Q07654 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TFF3Q07654 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TFF3Q07654 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TFF3Q07654 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TFF3Q07654 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TFF3Q07654 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TFF3Q07654 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TFF3Q07654 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TFF3Q07654 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TFF3Q07654 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TFF3Q07654 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TFF3Q07654 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TFF3Q07654 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TFF3Q07654 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TFF3Q07654 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TFF3Q07654 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TFF3Q07654 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TFF3Q07654 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TFF3Q07654 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TFF3Q07654 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TFF3Q07654 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TFF3Q07654 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TFF3Q07654 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TFF3Q07654 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TFF3Q07654 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TFF3Q07654 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TFF3Q07654 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TFF3Q07654 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TFF3Q07654 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TFF3Q07654 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TFF3Q07654 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TFF3Q07654 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms