Protein–RNA interactions for Protein: Q07084

SSK1, Osmolarity two-component system protein SSK1, yeastyeast

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Length 712 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSK1Q07084 YBR141W-AYBR141W-A 96 nt3.71□□□□□ -1.82
SSK1Q07084 ERV15YBR210W 429 nt3.71□□□□□ -1.82
SSK1Q07084 MRPL27YBR282W 441 nt3.71□□□□□ -1.82
SSK1Q07084 TRM12YML005W 1389 nt3.71□□□□□ -1.82
SSK1Q07084 APM3YBR288C 1452 nt3.71□□□□□ -1.82
SSK1Q07084 YDR131CYDR131C 1671 nt3.71□□□□□ -1.82
SSK1Q07084 KIP3YGL216W 2418 nt3.71□□□□□ -1.82
SSK1Q07084 SEG1YMR086W 2883 nt3.7□□□□□ -1.82
SSK1Q07084 YGL088WYGL088W 366 nt3.7□□□□□ -1.82
SSK1Q07084 ECM34YHL043W 513 nt3.7□□□□□ -1.82
SSK1Q07084 IRC9YJL142C 393 nt3.7□□□□□ -1.82
SSK1Q07084 YNK1YKL067W 462 nt3.7□□□□□ -1.82
SSK1Q07084 YLR347W-AYLR347W-A 141 nt3.7□□□□□ -1.82
SSK1Q07084 YML031C-AYML031C-A 336 nt3.7□□□□□ -1.82
SSK1Q07084 TEM1YML064C 738 nt3.7□□□□□ -1.82
SSK1Q07084 YMR158C-AYMR158C-A 138 nt3.7□□□□□ -1.82
SSK1Q07084 RPS11BYBR048W 471 nt3.7□□□□□ -1.82
SSK1Q07084 MRPL51YPR100W 423 nt3.7□□□□□ -1.82
SSK1Q07084 YER077CYER077C 2067 nt3.7□□□□□ -1.82
SSK1Q07084 CEX1YOR112W 2286 nt3.7□□□□□ -1.82
SSK1Q07084 MNL1YHR204W 2391 nt3.7□□□□□ -1.82
SSK1Q07084 UBX5YDR330W 1503 nt3.7□□□□□ -1.82
SSK1Q07084 SST2YLR452C 2097 nt3.69□□□□□ -1.82
SSK1Q07084 SAG1YJR004C 1953 nt3.69□□□□□ -1.82
SSK1Q07084 DIP2YLR129W 2832 nt3.69□□□□□ -1.82
SSK1Q07084 PRS5YOL061W 1491 nt3.69□□□□□ -1.82
SSK1Q07084 SAS5YOR213C 747 nt3.69□□□□□ -1.82
SSK1Q07084 FDH1YOR388C 1131 nt3.69□□□□□ -1.82
SSK1Q07084 GDT1YBR187W 843 nt3.69□□□□□ -1.82
SSK1Q07084 BUD6YLR319C 2367 nt3.69□□□□□ -1.82
SSK1Q07084 URC2YDR520C 2319 nt3.69□□□□□ -1.82
SSK1Q07084 ORC4YPR162C 1590 nt3.68□□□□□ -1.82
SSK1Q07084 DPH6YLR143W 2058 nt3.68□□□□□ -1.82
SSK1Q07084 RPS13YDR064W 456 nt3.68□□□□□ -1.82
SSK1Q07084 SPT3YDR392W 1014 nt3.68□□□□□ -1.82
SSK1Q07084 YGL138CYGL138C 1038 nt3.68□□□□□ -1.82
SSK1Q07084 OST5YGL226C-A 261 nt3.68□□□□□ -1.82
SSK1Q07084 YHL044WYHL044W 708 nt3.68□□□□□ -1.82
SSK1Q07084 YVH1YIR026C 1095 nt3.68□□□□□ -1.82
SSK1Q07084 SRP40YKR092C 1221 nt3.68□□□□□ -1.82
SSK1Q07084 CSI1YMR025W 888 nt3.68□□□□□ -1.82
SSK1Q07084 TRM112YNR046W 408 nt3.68□□□□□ -1.82
SSK1Q07084 UTP23YOR004W 765 nt3.68□□□□□ -1.82
SSK1Q07084 DSS1YMR287C 2910 nt3.68□□□□□ -1.82
SSK1Q07084 BIK1YCL029C 1323 nt3.68□□□□□ -1.82
SSK1Q07084 MCD4YKL165C 2760 nt3.68□□□□□ -1.82
SSK1Q07084 BI3Q0115 1554 nt3.68□□□□□ -1.82
SSK1Q07084 PHM7YOL084W 2976 nt3.67□□□□□ -1.82
SSK1Q07084 SPT23YKL020C 3249 nt3.67□□□□□ -1.82
SSK1Q07084 GCR1YPL075W 2358 nt3.67□□□□□ -1.82
SSK1Q07084 NCR1YPL006W 3513 nt3.67□□□□□ -1.82
SSK1Q07084 UBP6YFR010W 1500 nt3.67□□□□□ -1.82
SSK1Q07084 TSC13YDL015C 933 nt3.67□□□□□ -1.82
SSK1Q07084 UBC9YDL064W 474 nt3.67□□□□□ -1.82
SSK1Q07084 RUB1YDR139C 234 nt3.67□□□□□ -1.82
SSK1Q07084 HTB1YDR224C 396 nt3.67□□□□□ -1.82
SSK1Q07084 LSB1YGR136W 726 nt3.67□□□□□ -1.82
SSK1Q07084 REE1YJL217W 597 nt3.67□□□□□ -1.82
SSK1Q07084 FMP46YKR049C 402 nt3.67□□□□□ -1.82
SSK1Q07084 SWC7YLR385C 399 nt3.67□□□□□ -1.82
SSK1Q07084 FOL3YMR113W 1284 nt3.67□□□□□ -1.82
SSK1Q07084 snR11snR11 258 nt3.67□□□□□ -1.82
SSK1Q07084 CAF20YOR276W 486 nt3.67□□□□□ -1.82
SSK1Q07084 YBR096WYBR096W 693 nt3.67□□□□□ -1.82
SSK1Q07084 CHL1YPL008W 2586 nt3.67□□□□□ -1.82
SSK1Q07084 YPR003CYPR003C 2265 nt3.67□□□□□ -1.82
SSK1Q07084 ELO2YCR034W 1044 nt3.66□□□□□ -1.82
SSK1Q07084 snR83snR83 306 nt3.66□□□□□ -1.82
SSK1Q07084 YPT35YHR105W 645 nt3.66□□□□□ -1.82
SSK1Q07084 CDC12YHR107C 1224 nt3.66□□□□□ -1.82
SSK1Q07084 YPT53YNL093W 663 nt3.66□□□□□ -1.82
SSK1Q07084 RPS19AYOL121C 435 nt3.66□□□□□ -1.82
SSK1Q07084 YGK3YOL128C 1128 nt3.66□□□□□ -1.82
SSK1Q07084 HPA2YPR193C 471 nt3.66□□□□□ -1.82
SSK1Q07084 ZDS1YMR273C 2748 nt3.66□□□□□ -1.82
SSK1Q07084 VPS45YGL095C 1734 nt3.66□□□□□ -1.82
SSK1Q07084 YLR108CYLR108C 1458 nt3.66□□□□□ -1.82
SSK1Q07084 UTP5YDR398W 1932 nt3.66□□□□□ -1.82
SSK1Q07084 NTH1YDR001C 2256 nt3.65□□□□□ -1.82
SSK1Q07084 MGA1YGR249W 1371 nt3.65□□□□□ -1.82
SSK1Q07084 ACE2YLR131C 2313 nt3.65□□□□□ -1.82
SSK1Q07084 GRS2YPR081C 1857 nt3.65□□□□□ -1.82
SSK1Q07084 GRX3YDR098C 858 nt3.65□□□□□ -1.83
SSK1Q07084 FCF1YDR339C 570 nt3.65□□□□□ -1.83
SSK1Q07084 PEF1YGR058W 1008 nt3.65□□□□□ -1.83
SSK1Q07084 TDA10YGR205W 873 nt3.65□□□□□ -1.83
SSK1Q07084 BNA1YJR025C 534 nt3.65□□□□□ -1.83
SSK1Q07084 CNB1YKL190W 528 nt3.65□□□□□ -1.83
SSK1Q07084 YAR075WYAR075W 474 nt3.65□□□□□ -1.83
SSK1Q07084 YNL050CYNL050C 813 nt3.65□□□□□ -1.83
SSK1Q07084 TPT1YOL102C 693 nt3.65□□□□□ -1.83
SSK1Q07084 YOR238WYOR238W 912 nt3.65□□□□□ -1.83
SSK1Q07084 PBP2YBR233W 1242 nt3.65□□□□□ -1.83
SSK1Q07084 TRM11YOL124C 1302 nt3.65□□□□□ -1.83
SSK1Q07084 YDR355CYDR355C 303 nt3.64□□□□□ -1.83
SSK1Q07084 KRE28YDR532C 1158 nt3.64□□□□□ -1.83
SSK1Q07084 SPI1YER150W 447 nt3.64□□□□□ -1.83
SSK1Q07084 YGL132WYGL132W 336 nt3.64□□□□□ -1.83
SSK1Q07084 SVP26YHR181W 687 nt3.64□□□□□ -1.83
SSK1Q07084 SUB1YMR039C 879 nt3.64□□□□□ -1.83
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