Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHRNB3Q05901 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHRNB3Q05901 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHRNB3Q05901 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHRNB3Q05901 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHRNB3Q05901 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHRNB3Q05901 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHRNB3Q05901 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHRNB3Q05901 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHRNB3Q05901 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHRNB3Q05901 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHRNB3Q05901 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHRNB3Q05901 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHRNB3Q05901 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHRNB3Q05901 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHRNB3Q05901 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHRNB3Q05901 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHRNB3Q05901 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHRNB3Q05901 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHRNB3Q05901 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHRNB3Q05901 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHRNB3Q05901 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHRNB3Q05901 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHRNB3Q05901 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHRNB3Q05901 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CHRNB3Q05901 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHRNB3Q05901 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHRNB3Q05901 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHRNB3Q05901 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHRNB3Q05901 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CHRNB3Q05901 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHRNB3Q05901 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHRNB3Q05901 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHRNB3Q05901 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHRNB3Q05901 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHRNB3Q05901 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHRNB3Q05901 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHRNB3Q05901 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHRNB3Q05901 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHRNB3Q05901 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHRNB3Q05901 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHRNB3Q05901 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHRNB3Q05901 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHRNB3Q05901 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CHRNB3Q05901 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CHRNB3Q05901 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHRNB3Q05901 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHRNB3Q05901 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHRNB3Q05901 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHRNB3Q05901 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHRNB3Q05901 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHRNB3Q05901 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHRNB3Q05901 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CHRNB3Q05901 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHRNB3Q05901 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CHRNB3Q05901 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHRNB3Q05901 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHRNB3Q05901 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHRNB3Q05901 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHRNB3Q05901 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHRNB3Q05901 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHRNB3Q05901 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHRNB3Q05901 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHRNB3Q05901 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHRNB3Q05901 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHRNB3Q05901 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHRNB3Q05901 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHRNB3Q05901 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHRNB3Q05901 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHRNB3Q05901 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHRNB3Q05901 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CHRNB3Q05901 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHRNB3Q05901 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHRNB3Q05901 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHRNB3Q05901 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHRNB3Q05901 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHRNB3Q05901 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHRNB3Q05901 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHRNB3Q05901 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHRNB3Q05901 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHRNB3Q05901 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHRNB3Q05901 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHRNB3Q05901 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CHRNB3Q05901 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHRNB3Q05901 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHRNB3Q05901 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHRNB3Q05901 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHRNB3Q05901 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CHRNB3Q05901 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHRNB3Q05901 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHRNB3Q05901 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHRNB3Q05901 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHRNB3Q05901 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHRNB3Q05901 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHRNB3Q05901 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHRNB3Q05901 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHRNB3Q05901 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHRNB3Q05901 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHRNB3Q05901 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHRNB3Q05901 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms