Protein–RNA interactions for Protein: Q04900

CD164, Sialomucin core protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD164Q04900 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CD164Q04900 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CD164Q04900 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CD164Q04900 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CD164Q04900 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CD164Q04900 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CD164Q04900 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CD164Q04900 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CD164Q04900 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CD164Q04900 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CD164Q04900 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CD164Q04900 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CD164Q04900 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CD164Q04900 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CD164Q04900 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CD164Q04900 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CD164Q04900 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CD164Q04900 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CD164Q04900 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CD164Q04900 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CD164Q04900 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CD164Q04900 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CD164Q04900 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CD164Q04900 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CD164Q04900 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CD164Q04900 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
CD164Q04900 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CD164Q04900 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CD164Q04900 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CD164Q04900 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CD164Q04900 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CD164Q04900 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CD164Q04900 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CD164Q04900 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CD164Q04900 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CD164Q04900 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CD164Q04900 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CD164Q04900 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CD164Q04900 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CD164Q04900 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
CD164Q04900 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CD164Q04900 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CD164Q04900 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CD164Q04900 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CD164Q04900 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CD164Q04900 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
CD164Q04900 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CD164Q04900 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CD164Q04900 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
CD164Q04900 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CD164Q04900 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CD164Q04900 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CD164Q04900 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
CD164Q04900 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
CD164Q04900 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
CD164Q04900 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
CD164Q04900 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
CD164Q04900 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
CD164Q04900 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
CD164Q04900 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
CD164Q04900 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
CD164Q04900 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.38
CD164Q04900 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
CD164Q04900 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
CD164Q04900 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
CD164Q04900 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
CD164Q04900 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
CD164Q04900 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CD164Q04900 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CD164Q04900 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CD164Q04900 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CD164Q04900 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CD164Q04900 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CD164Q04900 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CD164Q04900 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CD164Q04900 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CD164Q04900 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CD164Q04900 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CD164Q04900 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CD164Q04900 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CD164Q04900 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CD164Q04900 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
CD164Q04900 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CD164Q04900 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CD164Q04900 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CD164Q04900 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CD164Q04900 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CD164Q04900 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CD164Q04900 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CD164Q04900 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CD164Q04900 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CD164Q04900 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CD164Q04900 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CD164Q04900 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CD164Q04900 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CD164Q04900 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CD164Q04900 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CD164Q04900 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CD164Q04900 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CD164Q04900 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms