Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SPIBQ01892 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SPIBQ01892 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SPIBQ01892 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SPIBQ01892 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SPIBQ01892 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SPIBQ01892 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SPIBQ01892 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SPIBQ01892 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SPIBQ01892 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SPIBQ01892 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SPIBQ01892 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SPIBQ01892 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SPIBQ01892 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SPIBQ01892 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SPIBQ01892 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SPIBQ01892 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SPIBQ01892 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SPIBQ01892 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SPIBQ01892 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SPIBQ01892 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SPIBQ01892 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SPIBQ01892 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SPIBQ01892 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SPIBQ01892 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SPIBQ01892 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SPIBQ01892 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SPIBQ01892 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SPIBQ01892 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SPIBQ01892 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SPIBQ01892 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SPIBQ01892 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SPIBQ01892 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SPIBQ01892 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SPIBQ01892 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SPIBQ01892 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SPIBQ01892 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SPIBQ01892 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SPIBQ01892 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SPIBQ01892 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SPIBQ01892 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SPIBQ01892 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SPIBQ01892 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SPIBQ01892 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SPIBQ01892 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SPIBQ01892 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SPIBQ01892 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SPIBQ01892 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SPIBQ01892 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SPIBQ01892 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SPIBQ01892 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SPIBQ01892 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SPIBQ01892 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SPIBQ01892 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SPIBQ01892 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SPIBQ01892 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SPIBQ01892 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SPIBQ01892 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SPIBQ01892 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
SPIBQ01892 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SPIBQ01892 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SPIBQ01892 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SPIBQ01892 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SPIBQ01892 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SPIBQ01892 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
SPIBQ01892 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SPIBQ01892 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
SPIBQ01892 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SPIBQ01892 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SPIBQ01892 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SPIBQ01892 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SPIBQ01892 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SPIBQ01892 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SPIBQ01892 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SPIBQ01892 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SPIBQ01892 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SPIBQ01892 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SPIBQ01892 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SPIBQ01892 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SPIBQ01892 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SPIBQ01892 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SPIBQ01892 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SPIBQ01892 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SPIBQ01892 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SPIBQ01892 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SPIBQ01892 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SPIBQ01892 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SPIBQ01892 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SPIBQ01892 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SPIBQ01892 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SPIBQ01892 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SPIBQ01892 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SPIBQ01892 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SPIBQ01892 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SPIBQ01892 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SPIBQ01892 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SPIBQ01892 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SPIBQ01892 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SPIBQ01892 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SPIBQ01892 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms