Protein–RNA interactions for Protein: Q01850

CDR2, Cerebellar degeneration-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR2Q01850 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDR2Q01850 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CDR2Q01850 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDR2Q01850 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDR2Q01850 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDR2Q01850 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDR2Q01850 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDR2Q01850 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDR2Q01850 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDR2Q01850 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CDR2Q01850 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDR2Q01850 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDR2Q01850 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDR2Q01850 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDR2Q01850 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDR2Q01850 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CDR2Q01850 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDR2Q01850 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CDR2Q01850 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CDR2Q01850 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDR2Q01850 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDR2Q01850 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDR2Q01850 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDR2Q01850 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDR2Q01850 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDR2Q01850 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDR2Q01850 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDR2Q01850 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDR2Q01850 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDR2Q01850 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDR2Q01850 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDR2Q01850 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDR2Q01850 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDR2Q01850 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDR2Q01850 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDR2Q01850 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDR2Q01850 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CDR2Q01850 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDR2Q01850 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDR2Q01850 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDR2Q01850 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDR2Q01850 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDR2Q01850 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDR2Q01850 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDR2Q01850 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDR2Q01850 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDR2Q01850 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDR2Q01850 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDR2Q01850 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDR2Q01850 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDR2Q01850 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDR2Q01850 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CDR2Q01850 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDR2Q01850 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDR2Q01850 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDR2Q01850 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDR2Q01850 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDR2Q01850 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDR2Q01850 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDR2Q01850 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDR2Q01850 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDR2Q01850 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDR2Q01850 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDR2Q01850 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CDR2Q01850 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDR2Q01850 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDR2Q01850 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDR2Q01850 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDR2Q01850 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDR2Q01850 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDR2Q01850 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDR2Q01850 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDR2Q01850 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDR2Q01850 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CDR2Q01850 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDR2Q01850 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDR2Q01850 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CDR2Q01850 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDR2Q01850 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDR2Q01850 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDR2Q01850 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDR2Q01850 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDR2Q01850 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDR2Q01850 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDR2Q01850 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDR2Q01850 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDR2Q01850 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDR2Q01850 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDR2Q01850 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDR2Q01850 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDR2Q01850 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDR2Q01850 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDR2Q01850 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDR2Q01850 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDR2Q01850 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDR2Q01850 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDR2Q01850 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDR2Q01850 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDR2Q01850 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDR2Q01850 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms