Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IRF9Q00978 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IRF9Q00978 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IRF9Q00978 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IRF9Q00978 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IRF9Q00978 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IRF9Q00978 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
IRF9Q00978 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IRF9Q00978 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IRF9Q00978 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IRF9Q00978 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IRF9Q00978 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IRF9Q00978 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IRF9Q00978 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IRF9Q00978 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IRF9Q00978 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IRF9Q00978 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IRF9Q00978 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IRF9Q00978 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IRF9Q00978 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IRF9Q00978 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
IRF9Q00978 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
IRF9Q00978 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
IRF9Q00978 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
IRF9Q00978 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
IRF9Q00978 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
IRF9Q00978 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
IRF9Q00978 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
IRF9Q00978 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IRF9Q00978 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IRF9Q00978 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
IRF9Q00978 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IRF9Q00978 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
IRF9Q00978 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.32■■□□□ 1
IRF9Q00978 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
IRF9Q00978 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
IRF9Q00978 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
IRF9Q00978 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
IRF9Q00978 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
IRF9Q00978 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
IRF9Q00978 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IRF9Q00978 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
IRF9Q00978 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.31■■□□□ 1
IRF9Q00978 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
IRF9Q00978 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IRF9Q00978 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
IRF9Q00978 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IRF9Q00978 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IRF9Q00978 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IRF9Q00978 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IRF9Q00978 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
IRF9Q00978 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IRF9Q00978 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IRF9Q00978 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IRF9Q00978 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IRF9Q00978 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IRF9Q00978 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.3■■□□□ 1
IRF9Q00978 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IRF9Q00978 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IRF9Q00978 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
IRF9Q00978 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
IRF9Q00978 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IRF9Q00978 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
IRF9Q00978 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
IRF9Q00978 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
IRF9Q00978 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IRF9Q00978 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IRF9Q00978 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
IRF9Q00978 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
IRF9Q00978 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
IRF9Q00978 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
IRF9Q00978 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
IRF9Q00978 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IRF9Q00978 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IRF9Q00978 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IRF9Q00978 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IRF9Q00978 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IRF9Q00978 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
IRF9Q00978 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
IRF9Q00978 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
IRF9Q00978 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
IRF9Q00978 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
IRF9Q00978 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IRF9Q00978 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IRF9Q00978 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IRF9Q00978 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IRF9Q00978 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IRF9Q00978 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IRF9Q00978 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IRF9Q00978 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IRF9Q00978 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
IRF9Q00978 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
IRF9Q00978 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.28■■□□□ 1
IRF9Q00978 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
IRF9Q00978 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IRF9Q00978 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IRF9Q00978 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
IRF9Q00978 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.27■■□□□ 1
IRF9Q00978 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
IRF9Q00978 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms