Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
CLTCQ00610 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
CLTCQ00610 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
CLTCQ00610 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
CLTCQ00610 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
CLTCQ00610 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
CLTCQ00610 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC31.82■■■□□ 2.68
CLTCQ00610 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
CLTCQ00610 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
CLTCQ00610 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
CLTCQ00610 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
CLTCQ00610 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
CLTCQ00610 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
CLTCQ00610 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
CLTCQ00610 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC31.8■■■□□ 2.68
CLTCQ00610 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
CLTCQ00610 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
CLTCQ00610 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
CLTCQ00610 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
CLTCQ00610 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
CLTCQ00610 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
CLTCQ00610 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC31.8■■■□□ 2.68
CLTCQ00610 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC31.8■■■□□ 2.68
CLTCQ00610 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
CLTCQ00610 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
CLTCQ00610 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
CLTCQ00610 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC31.78■■■□□ 2.68
CLTCQ00610 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
CLTCQ00610 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
CLTCQ00610 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
CLTCQ00610 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
CLTCQ00610 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC31.78■■■□□ 2.68
CLTCQ00610 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
CLTCQ00610 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
CLTCQ00610 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
CLTCQ00610 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
CLTCQ00610 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
CLTCQ00610 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC31.77■■■□□ 2.68
CLTCQ00610 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
CLTCQ00610 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
CLTCQ00610 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
CLTCQ00610 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
CLTCQ00610 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
CLTCQ00610 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
CLTCQ00610 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
CLTCQ00610 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
CLTCQ00610 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
CLTCQ00610 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.68
CLTCQ00610 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC31.76■■■□□ 2.68
CLTCQ00610 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
CLTCQ00610 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
CLTCQ00610 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.68
CLTCQ00610 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
CLTCQ00610 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
CLTCQ00610 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
CLTCQ00610 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC31.76■■■□□ 2.67
CLTCQ00610 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
CLTCQ00610 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC31.76■■■□□ 2.67
CLTCQ00610 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
CLTCQ00610 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
CLTCQ00610 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
CLTCQ00610 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
CLTCQ00610 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
CLTCQ00610 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC31.75■■■□□ 2.67
CLTCQ00610 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
CLTCQ00610 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
CLTCQ00610 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
CLTCQ00610 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
CLTCQ00610 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
CLTCQ00610 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
CLTCQ00610 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
CLTCQ00610 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
CLTCQ00610 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
CLTCQ00610 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
CLTCQ00610 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
CLTCQ00610 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC31.73■■■□□ 2.67
CLTCQ00610 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
CLTCQ00610 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
CLTCQ00610 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
CLTCQ00610 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
CLTCQ00610 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.73■■■□□ 2.67
CLTCQ00610 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
CLTCQ00610 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC31.73■■■□□ 2.67
CLTCQ00610 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
CLTCQ00610 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
CLTCQ00610 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
CLTCQ00610 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
CLTCQ00610 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
CLTCQ00610 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
CLTCQ00610 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC31.72■■■□□ 2.67
CLTCQ00610 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
CLTCQ00610 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
CLTCQ00610 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
CLTCQ00610 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
CLTCQ00610 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
CLTCQ00610 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
CLTCQ00610 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC31.71■■■□□ 2.67
CLTCQ00610 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
CLTCQ00610 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
CLTCQ00610 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms