Protein–RNA interactions for Protein: Q00532

CDKL1, Cyclin-dependent kinase-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL1Q00532 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDKL1Q00532 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDKL1Q00532 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDKL1Q00532 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDKL1Q00532 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDKL1Q00532 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDKL1Q00532 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDKL1Q00532 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CDKL1Q00532 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDKL1Q00532 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDKL1Q00532 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDKL1Q00532 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDKL1Q00532 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDKL1Q00532 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDKL1Q00532 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDKL1Q00532 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDKL1Q00532 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDKL1Q00532 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDKL1Q00532 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDKL1Q00532 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDKL1Q00532 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDKL1Q00532 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDKL1Q00532 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDKL1Q00532 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDKL1Q00532 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDKL1Q00532 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDKL1Q00532 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDKL1Q00532 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDKL1Q00532 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDKL1Q00532 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CDKL1Q00532 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CDKL1Q00532 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDKL1Q00532 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CDKL1Q00532 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDKL1Q00532 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDKL1Q00532 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDKL1Q00532 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CDKL1Q00532 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDKL1Q00532 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDKL1Q00532 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDKL1Q00532 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDKL1Q00532 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDKL1Q00532 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDKL1Q00532 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDKL1Q00532 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDKL1Q00532 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDKL1Q00532 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDKL1Q00532 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CDKL1Q00532 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDKL1Q00532 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDKL1Q00532 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDKL1Q00532 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDKL1Q00532 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDKL1Q00532 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDKL1Q00532 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDKL1Q00532 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDKL1Q00532 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDKL1Q00532 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDKL1Q00532 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDKL1Q00532 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDKL1Q00532 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDKL1Q00532 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDKL1Q00532 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDKL1Q00532 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CDKL1Q00532 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDKL1Q00532 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDKL1Q00532 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDKL1Q00532 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDKL1Q00532 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDKL1Q00532 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDKL1Q00532 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDKL1Q00532 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDKL1Q00532 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDKL1Q00532 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDKL1Q00532 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDKL1Q00532 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDKL1Q00532 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDKL1Q00532 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDKL1Q00532 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDKL1Q00532 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDKL1Q00532 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDKL1Q00532 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDKL1Q00532 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDKL1Q00532 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDKL1Q00532 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDKL1Q00532 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDKL1Q00532 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDKL1Q00532 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDKL1Q00532 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDKL1Q00532 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CDKL1Q00532 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDKL1Q00532 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDKL1Q00532 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CDKL1Q00532 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CDKL1Q00532 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDKL1Q00532 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDKL1Q00532 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDKL1Q00532 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDKL1Q00532 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDKL1Q00532 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms