Protein–RNA interactions for Protein: Q00526

CDK3, Cyclin-dependent kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK3Q00526 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDK3Q00526 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDK3Q00526 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDK3Q00526 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDK3Q00526 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDK3Q00526 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDK3Q00526 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDK3Q00526 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDK3Q00526 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDK3Q00526 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDK3Q00526 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDK3Q00526 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CDK3Q00526 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDK3Q00526 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDK3Q00526 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDK3Q00526 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDK3Q00526 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CDK3Q00526 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDK3Q00526 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDK3Q00526 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDK3Q00526 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDK3Q00526 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDK3Q00526 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDK3Q00526 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDK3Q00526 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDK3Q00526 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CDK3Q00526 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDK3Q00526 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDK3Q00526 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDK3Q00526 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CDK3Q00526 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDK3Q00526 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDK3Q00526 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDK3Q00526 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDK3Q00526 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDK3Q00526 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDK3Q00526 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDK3Q00526 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDK3Q00526 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDK3Q00526 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDK3Q00526 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDK3Q00526 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDK3Q00526 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDK3Q00526 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDK3Q00526 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDK3Q00526 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDK3Q00526 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDK3Q00526 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDK3Q00526 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDK3Q00526 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDK3Q00526 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDK3Q00526 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDK3Q00526 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDK3Q00526 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDK3Q00526 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDK3Q00526 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDK3Q00526 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDK3Q00526 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDK3Q00526 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDK3Q00526 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDK3Q00526 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDK3Q00526 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDK3Q00526 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDK3Q00526 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDK3Q00526 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDK3Q00526 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDK3Q00526 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDK3Q00526 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDK3Q00526 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDK3Q00526 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDK3Q00526 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDK3Q00526 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDK3Q00526 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDK3Q00526 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDK3Q00526 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDK3Q00526 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDK3Q00526 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CDK3Q00526 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CDK3Q00526 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDK3Q00526 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDK3Q00526 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDK3Q00526 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDK3Q00526 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDK3Q00526 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDK3Q00526 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CDK3Q00526 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDK3Q00526 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDK3Q00526 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDK3Q00526 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDK3Q00526 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDK3Q00526 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDK3Q00526 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDK3Q00526 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDK3Q00526 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CDK3Q00526 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDK3Q00526 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDK3Q00526 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDK3Q00526 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDK3Q00526 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDK3Q00526 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms