Protein–RNA interactions for Protein: P98174

FGD1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD1P98174 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
FGD1P98174 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FGD1P98174 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FGD1P98174 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FGD1P98174 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FGD1P98174 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FGD1P98174 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FGD1P98174 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FGD1P98174 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FGD1P98174 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FGD1P98174 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FGD1P98174 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FGD1P98174 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FGD1P98174 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FGD1P98174 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FGD1P98174 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FGD1P98174 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FGD1P98174 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
FGD1P98174 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
FGD1P98174 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
FGD1P98174 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
FGD1P98174 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
FGD1P98174 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
FGD1P98174 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
FGD1P98174 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
FGD1P98174 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
FGD1P98174 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
FGD1P98174 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
FGD1P98174 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
FGD1P98174 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
FGD1P98174 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
FGD1P98174 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FGD1P98174 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FGD1P98174 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FGD1P98174 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FGD1P98174 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FGD1P98174 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FGD1P98174 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FGD1P98174 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FGD1P98174 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FGD1P98174 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FGD1P98174 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FGD1P98174 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FGD1P98174 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FGD1P98174 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FGD1P98174 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FGD1P98174 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FGD1P98174 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FGD1P98174 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FGD1P98174 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FGD1P98174 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
FGD1P98174 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FGD1P98174 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FGD1P98174 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FGD1P98174 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FGD1P98174 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FGD1P98174 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
FGD1P98174 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FGD1P98174 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FGD1P98174 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FGD1P98174 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FGD1P98174 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FGD1P98174 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FGD1P98174 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FGD1P98174 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FGD1P98174 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FGD1P98174 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FGD1P98174 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FGD1P98174 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
FGD1P98174 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
FGD1P98174 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FGD1P98174 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FGD1P98174 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FGD1P98174 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FGD1P98174 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FGD1P98174 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FGD1P98174 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FGD1P98174 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FGD1P98174 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FGD1P98174 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FGD1P98174 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FGD1P98174 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FGD1P98174 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FGD1P98174 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FGD1P98174 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FGD1P98174 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FGD1P98174 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FGD1P98174 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FGD1P98174 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FGD1P98174 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FGD1P98174 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FGD1P98174 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FGD1P98174 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FGD1P98174 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FGD1P98174 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FGD1P98174 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
FGD1P98174 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FGD1P98174 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
FGD1P98174 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FGD1P98174 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms