Protein–RNA interactions for Protein: P78545

ELF3, ETS-related transcription factor Elf-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELF3P78545 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
ELF3P78545 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
ELF3P78545 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ELF3P78545 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ELF3P78545 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ELF3P78545 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ELF3P78545 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
ELF3P78545 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ELF3P78545 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ELF3P78545 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ELF3P78545 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ELF3P78545 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ELF3P78545 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ELF3P78545 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ELF3P78545 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ELF3P78545 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ELF3P78545 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ELF3P78545 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ELF3P78545 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ELF3P78545 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ELF3P78545 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ELF3P78545 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ELF3P78545 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ELF3P78545 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ELF3P78545 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ELF3P78545 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ELF3P78545 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ELF3P78545 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ELF3P78545 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ELF3P78545 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ELF3P78545 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ELF3P78545 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ELF3P78545 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ELF3P78545 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ELF3P78545 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ELF3P78545 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ELF3P78545 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ELF3P78545 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ELF3P78545 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ELF3P78545 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ELF3P78545 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ELF3P78545 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ELF3P78545 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ELF3P78545 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ELF3P78545 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ELF3P78545 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ELF3P78545 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ELF3P78545 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ELF3P78545 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ELF3P78545 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ELF3P78545 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ELF3P78545 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ELF3P78545 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ELF3P78545 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ELF3P78545 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ELF3P78545 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ELF3P78545 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ELF3P78545 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ELF3P78545 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ELF3P78545 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ELF3P78545 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ELF3P78545 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ELF3P78545 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ELF3P78545 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ELF3P78545 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ELF3P78545 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ELF3P78545 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
ELF3P78545 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ELF3P78545 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ELF3P78545 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ELF3P78545 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ELF3P78545 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ELF3P78545 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ELF3P78545 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ELF3P78545 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ELF3P78545 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ELF3P78545 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ELF3P78545 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ELF3P78545 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ELF3P78545 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ELF3P78545 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
ELF3P78545 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ELF3P78545 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ELF3P78545 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ELF3P78545 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ELF3P78545 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ELF3P78545 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
ELF3P78545 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ELF3P78545 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ELF3P78545 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ELF3P78545 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ELF3P78545 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ELF3P78545 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ELF3P78545 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ELF3P78545 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ELF3P78545 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ELF3P78545 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ELF3P78545 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ELF3P78545 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ELF3P78545 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms