Protein–RNA interactions for Protein: P78369

CLDN10, Claudin-10, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN10P78369 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLDN10P78369 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLDN10P78369 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLDN10P78369 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLDN10P78369 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLDN10P78369 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLDN10P78369 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLDN10P78369 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLDN10P78369 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLDN10P78369 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLDN10P78369 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLDN10P78369 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLDN10P78369 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLDN10P78369 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLDN10P78369 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLDN10P78369 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLDN10P78369 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLDN10P78369 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLDN10P78369 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CLDN10P78369 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLDN10P78369 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLDN10P78369 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLDN10P78369 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLDN10P78369 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLDN10P78369 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLDN10P78369 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CLDN10P78369 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLDN10P78369 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLDN10P78369 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLDN10P78369 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLDN10P78369 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLDN10P78369 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLDN10P78369 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLDN10P78369 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLDN10P78369 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLDN10P78369 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLDN10P78369 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLDN10P78369 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLDN10P78369 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLDN10P78369 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CLDN10P78369 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLDN10P78369 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CLDN10P78369 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLDN10P78369 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLDN10P78369 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLDN10P78369 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLDN10P78369 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLDN10P78369 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLDN10P78369 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLDN10P78369 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLDN10P78369 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLDN10P78369 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLDN10P78369 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLDN10P78369 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLDN10P78369 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLDN10P78369 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLDN10P78369 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLDN10P78369 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLDN10P78369 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLDN10P78369 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLDN10P78369 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLDN10P78369 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLDN10P78369 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLDN10P78369 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLDN10P78369 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLDN10P78369 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLDN10P78369 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLDN10P78369 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLDN10P78369 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLDN10P78369 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLDN10P78369 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLDN10P78369 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLDN10P78369 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLDN10P78369 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLDN10P78369 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLDN10P78369 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLDN10P78369 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLDN10P78369 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLDN10P78369 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLDN10P78369 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLDN10P78369 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLDN10P78369 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLDN10P78369 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLDN10P78369 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLDN10P78369 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLDN10P78369 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLDN10P78369 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLDN10P78369 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CLDN10P78369 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLDN10P78369 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLDN10P78369 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLDN10P78369 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLDN10P78369 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CLDN10P78369 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CLDN10P78369 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLDN10P78369 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLDN10P78369 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLDN10P78369 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLDN10P78369 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLDN10P78369 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.2 ms