Protein–RNA interactions for Protein: P69891

HBG1, Hemoglobin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBG1P69891 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HBG1P69891 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HBG1P69891 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HBG1P69891 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HBG1P69891 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HBG1P69891 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HBG1P69891 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HBG1P69891 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
HBG1P69891 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HBG1P69891 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HBG1P69891 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HBG1P69891 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HBG1P69891 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HBG1P69891 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HBG1P69891 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HBG1P69891 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HBG1P69891 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HBG1P69891 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HBG1P69891 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HBG1P69891 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HBG1P69891 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HBG1P69891 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HBG1P69891 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HBG1P69891 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HBG1P69891 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HBG1P69891 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HBG1P69891 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HBG1P69891 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HBG1P69891 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HBG1P69891 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HBG1P69891 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HBG1P69891 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HBG1P69891 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HBG1P69891 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HBG1P69891 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HBG1P69891 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HBG1P69891 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HBG1P69891 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HBG1P69891 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HBG1P69891 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HBG1P69891 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HBG1P69891 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HBG1P69891 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HBG1P69891 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HBG1P69891 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HBG1P69891 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HBG1P69891 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HBG1P69891 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HBG1P69891 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HBG1P69891 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HBG1P69891 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HBG1P69891 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HBG1P69891 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HBG1P69891 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HBG1P69891 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HBG1P69891 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HBG1P69891 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HBG1P69891 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HBG1P69891 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HBG1P69891 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HBG1P69891 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HBG1P69891 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HBG1P69891 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HBG1P69891 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HBG1P69891 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HBG1P69891 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HBG1P69891 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HBG1P69891 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HBG1P69891 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HBG1P69891 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HBG1P69891 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HBG1P69891 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HBG1P69891 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HBG1P69891 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HBG1P69891 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HBG1P69891 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HBG1P69891 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
HBG1P69891 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HBG1P69891 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HBG1P69891 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HBG1P69891 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HBG1P69891 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HBG1P69891 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HBG1P69891 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HBG1P69891 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HBG1P69891 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HBG1P69891 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HBG1P69891 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HBG1P69891 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HBG1P69891 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HBG1P69891 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HBG1P69891 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HBG1P69891 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HBG1P69891 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HBG1P69891 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HBG1P69891 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
HBG1P69891 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
HBG1P69891 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HBG1P69891 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HBG1P69891 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms